Io normalmente dopo l'amplificazione imposto il termociclatore a 4ºC, in modo da interrompere il processo di PCR e mantenere il mio prodotto di PCR a una temperatura adeguata.
Come ti hanno già risposto la sospensione finale ad una bassa temperatura serve per mantenere i campioni dopo la PCR, se non sei subito lì a toglierli dal thermalcycler e metterli in frigo.
Il fatto di utilizzare 10°C anziché 4°C viene fatto perchè tenere il thermalcycler a 4°C per un tempo lungo potrebbe a lungo andare danneggiarlo.