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brunilde
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
 Inserito il - 15 gennaio 2016 : 21:55:06
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ciao a tutti, sono alle prese con un esercizio di genetica che potrebbe capitare, ma non ho idea di come riuscire a svolgerlo! Sul libro c'è ben poco di questi esercizi:"la genotipizzazione di una serie di soggetti ha dato i seguenti risultati T/T A/A 488 ; T/C A/G 424; C/C T/G 88.quali conclusioni possiamo trarre?" Premetto avevo un esercizio in cui osservavo tutti i genotipi possibili e osservavo le combinazioni date. Ho provato a fare lo stesso, seguendo il modello dell'altro esercizio e mi vengono queste possibili combinazioni: T/T A/A; T/T A/T; T/T T/T; T/C A/A; T/C A/T;T/C T/T; C/C A/A; C/C A/T; C/C T/T. ovviamente non trovo ne T/C A/G (che non vorrei fosse un doppio eterozigote e non saprei in quanto è difficile ricostruire l'aplotipo) e neanche C/C T/G. nell'esercizio che ho già svolto analizzavo il tutto in un tabella di contingenza per vedere se la distribuzione aplotipica era in equilibrio con il test del chi quadro. Non so se mi sono spiegata bene, potete darmi qualche dritta? grazie mille
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 19 gennaio 2016 : 15:37:36
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Sicura che di aver scritto i genotipi giusti?
Citazione:
T/T A/A 488 ; T/C A/G 424; C/C T/G 88.
Non era invece:
T/T A/A 488 ; T/C A/G 424; C/C G/G 88.?
A parte questo, quello che hai fatto dopo non l'ho capito!
(N.B. ho aggiunto solo i colori a quello che hai scritto tu)
Citazione:
Ho provato a fare lo stesso, seguendo il modello dell'altro esercizio e mi vengono queste possibili combinazioni: T/T A/A; T/T A/T; T/T T/T; T/C A/A; T/C A/T; T/C T/T; C/C A/A; C/C A/T; C/C T/T.
Avresti due loci entrambi con 2 alleli (se è giusta la correzione che ho fatto sopra), tutte le combinazioni che hai scritto sopra da dove salterebbero fuori?
Nel primo (che ho segnato in blu) hai gli alleli T e C, e qua hai segnato infatti come genotipi possibili T/T, T/C e C/C.
Nel secondo (rosso), secondo me c'è l'errore che ti ho segnalato, ma comunque se anche fossero 3 alleli come hai scritto tu, ovvero A, G e T le combinazioni sarebbero di più di quelle che hai scritto tu, ovvero: A/A, A/T e T/T
ci sarebbero anche quelle con la G, quindi:
Citazione:
non trovo ne T/C A/G (che non vorrei fosse un doppio eterozigote e non saprei in quanto è difficile ricostruire l'aplotipo) e neanche C/C T/G.
non le trovi perchè non le hai scritte.
Comunque ti ripeto, secondo me c'è l'errore che ti ho segnalato all'inizio e i loco sono entrambi biallelici, e l'aplitopo devi valutarlo su quelli. |
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nanààà
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
Inserito il - 20 gennaio 2016 : 17:35:03
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Salve. all'ultimo esame di genetica avevo lo stesso esercizio, ma con molti più genotipi. effettivamente ha ragione GFPina,l'ultima serie è C/C G/G. ad ogni modo, ho cercato ovunque sul libro e su internet, ma non ho trovato nulla che spiegasse questa cosa.
so che devo tenere in considerazione che i loci sono vicini e quindi vengono ereditati assieme. ma dal numero di individui cosa dovrei concludere.
sarà la prima domanda che la prof mi farà all'esame, quindi vi sarei molto grata se potesse aiutarmi |
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brunilde
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 20 gennaio 2016 : 20:49:28
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vi allego l'unico esercizio simile che ho negli appunti (appunti che sono però della trinennale!) se l'ultimo genotipo è C/C G/G è molto simile a questo
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brunilde
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 20 gennaio 2016 : 21:07:58
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Le immagini sono venute un tantino giganti! Comunque in questo esercizio vengono dati i genotipi, sommando il numero di individui e moltiplicando per due ho il numero degli aplotipi possibili, successivamente nell'esercizio vengono analizzati i dati nella tabella di contingenza e si procede con un test d'ipotesi per verificare se la distribuzione aplotipica è in equilibrio. Non so se c'è un modo più diretto per dedurlo o se effettivamente la domanda del "problema"intenda questo!
Tra l'altro su questi appunti si parla di difficoltà nel ricostruire l'aplotipo per un "doppio eterozigote".Se esiste qualche esercizio simile o dei passaggi chiave, un metodo per svolgerlo, sarebbe fantastico per capirci qualcosa, come dice nanàà non c'è alcun tipo di riferimento sul libro e a lezione (quelle che ho seguito io) non sono stati fatti esercizi simili. Sono giorni e giorni che mi ci spremo il cervello ma non ne riesco a venire a capo :( |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2016 : 17:03:29
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Ho ridotto le immagini.
Per quanto riguarda l'esercizio, visto che nanààà ha confermato che la mia correzione era corretta, secondo me si vede molto chiaramente ad occhio. Ma procediamo con calma.
Non so se i vostri docenti vogliono che lo risolviate con la tabella di contingenza come negli esempi indicati da brunilde, io posso solo indicarvi come lo risolverei io.
L'esercizio in realtà mi sembra più semplice di quello indicato nell'esempio.
Comunque, stabilito che i genotipi sono questi:
T/T A/A 488
T/C A/G 424
C/C G/G 88
Iniziate ad indicare quali sono gli aplotipi possibili per ognuno di questi tre genotipi.
Poi nel caso del doppio eterozigote (la cosa non è poi così complicata) secondo voi qual è il più probabile e perchè?
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nanààà
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2016 : 17:42:37
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Il mio problema è proprio questo, non capisco cosa si intende per Aplotipi possibili.
Allora, io so che i loci sono due ed ognuno ha due alleli (T/C e A/G).
Numero di aplotipi 2^n = 4 aplotipi possibili:
T/A T/G C/A C/G ? |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2016 : 18:25:57
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Citazione:
T/A T/G C/A C/G ?
Scusa ma così non si capisce niente, fai il disegnino come indicato nell'esempio di brunilde. |
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nanààà
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2016 : 19:10:22
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Immagine:
2259847 |
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nanààà
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2016 : 19:11:55
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Non capisco perché l'abbia capovolta. Scusate ma non so come modificarla |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2016 : 19:31:20
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Citazione:
Messaggio inserito da nanààà
Non capisco perché l'abbia capovolta. Scusate ma non so come modificarla
Va beh, almeno l'ho ridotta perchè era anche enorme!
Comunque a parte quello che hai scritto, ora dovresti fare quello che ti ho chiesto, ovvero ad ogni genotipo associare il suo aplotipo.
es. T/T A/A 488
devi fare un disegnino così:
_T_________A_
_T_________A_ |
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brunilde
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 24 gennaio 2016 : 18:26:48
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eccomi, scusate ma sto combattendo con la connessione internet da giorni! Allora, una volta associato genotipo con aplotipo,
_T_____A_
_T_____A_ Genotipo T/T A/A 488
_C_____G_
_C_____G_ Genotipo C/C G/G 88
_T_____A_
_C_____G_
Oppure
_T_____G_
_C_____A_
Per il Genotipo doppio eterozigote T/C A/G 424
In questo caso è difficile ricostruire l'aplotipo esatto perchè si tratta di doppi eterozigoti, credo, (non vorrei dire una castroneria quindi mi scuso in anticipo) che in assenza di crossing over/ eventi di ricombinazione forse l'aplotipo più probabile per il genotipo doppio eterozigote in questione è:
_T___A_
_C___G_
data anche la numerosità dei genotipi riscontrati. Sono totalmente fuori strada?
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 25 gennaio 2016 : 13:29:27
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Sì esatto brunilde!
E sopratutto se l'aplotipo del doppio eterozigote fosse stato questo:
_T_____G_
_C_____A_
avresti dovuto trovare anche individui:
T/T G/G e C/C A/A
che invece non vedi! |
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brunilde
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 26 gennaio 2016 : 15:02:08
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| grazie mille! sei stata fondamentale per la risoluzione dell'esercizio!!!! |
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esercizio aplotipi
