Ciao a tutti, Oggi vi espongo il mio problema con un inibitore abbastanza rompino. I dovrei calcolare la IC50 di un inibitore analogo del substrato di un enzima che però è poco solubile. La massima solubilità che sono riuscito a ottenere in tampone di reazione (Hepes 50 mM pH 7)è di 1 mM. Il problema è che non riesco a ottenere una inibizione decente a questa concentrazione utilizzando una concentrazione di substrato di circa 100 uM (considerate che la Km dell'enzima è 45 uM). infatti ottengo una inibizione di circa il 10%. Io ho eseguito delle misurazioni dopo 10 minuti di incubazione ottenendo il 30% del prodotto nella reazione senza inibitore. Ho pensato che potrei ridurre ancora il substrato, ma non bisognerebbe rimanere sopra la Km? Inoltre io devo poter vedere il prodotto in HPLC e sotto una certa quantità non riesco a rilevarlo.
Cosa posso fare? Sto sbagliando qualcosa di concettuale?