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Tag   epigenetica    istoni    espressione genica    h3k27me3    chip  Aggiungi Tag

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_Feda
Nuovo Arrivato

Città: Roma


6 Messaggi

Inserito il - 05 novembre 2016 : 18:40:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di _Feda Invia a _Feda un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti!
Sono una studentessa che sta lavorando al suo piccolo progetto di tesi specialistica e devo fare una ChIP per andare a vedere la presenza della modifica istonica H3K27me3 su alcuni geni HOX del cluster A.

Il mio quesito è: dove vado a cercare la presenza di questa modifica lungo il gene?

Sembrerebbe banale, ma ho trovato moltissimi articoli che affermano come la sua presenza a cavallo del TSS sia associata a repressione genica (bayer et al. 2006 - Nature. Solo uno dei tanti esempi), e molti altri che mi parlano della "canonica modifica di repressione genica" (Wang e Dostie 2016, Nucleic acid research, dati di ChIP-seq da UCSC)quale la presenza di H3K27me3 sul corpo del gene (“Epigenetic regulation of development by histone lysine methylation” Dambacher et al., 2011).

Sicuramente hanno entrambe un ruolo di repressione dell'espressione genica, ma non ho trovato alcun articolo/review che analizzi in contemporanea questa modifica sul promotore e sul corpo del gene e che magari evidenzi delle differenze (se vi sono) tra la sua presenza nei due siti.

Qualcuno sa aiutarmi?

Vi ringrazio in anticipo!

The important thing is not to stop questioning. Curiosity has its own reason for existing. One cannot help but be in awe when he contemplates the mysteries of eternity, of life, of the marvelous structure of reality. It is enough if one tries merely to comprehend a little of this mystery every day.
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