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kiko74
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Inserito il - 12 aprile 2007 : 11:09:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kiko74 Invia a kiko74 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti.
La mia domanda è questa:
L'ATP sintasi(mitocondriale) catalizza la sintesi di ATP a partire da ADP e Pi.
Ora si sa che il gradiente protonico generato dalla catena respiratoria non ha alcun effetto diretto sulla sintesi di ATP ma favorisce solo il distacco della molecola neoformata dall'enzima.
Strutturalmente l'enzima è formato da 2 regioni che comprendono:
  • regione Fo che si estende da una faccia all'altra della membrana mitocondriale interna e costituita da un anello di 10-14 subunità c che costituisce il canale protonico e da una subunità a che lega le subunita c e che contiene due semicanali (uno collegato al citosol e l'altro collegato alla matrice mitocondriale)
  • regione F1 che si estende all'interno della matrice e forma una struttura bulbosa costituita da un esamero formato da 3 subunita alfa e tre subunita beta. queste ultime sono cruciali per la sintesi di ATP. Al centro dell'esamero è presente una subunita gamma che rompe la simmetria tra le subunità beta e permette quindi la transizione di queste ultime in tre stati conformazionale dei quali uno ha bassa affinità per ATP uno ha un'affinità per ADP e Pi e il terzo ha attività catalitica formando ATP da ADP e Pi

Le due regioni quindi sono connesse da uno stelo centrale formato dalle subunità gamma ed epsilon e da uno stelo esterno formato dalle subunità a, b2 e sigma.
Lo stelo centrale e il canale formato dalle subunità c sono definiti nel loro insieme UNITA' MOBILE O ROTATORE mentre il resto della molecola costituisce l'unità immobile o STATORE.
La domanda è questa se la rotazione ANTIORARIA della subunità gamma permette la sintesi di ATP, quale sarà la rotazione del canale protonico considerando che il meccanismo di funzionamento di questo è correlato alla protonazione di un residuo di aspartato in posizione 62 delle subunità c. Cioè considerando che attraverso i semicanali citoplasmatici e della matrice si ha un afflusso di protoni e considerando che questi legano l'aspartato rendendolo neutro quale sara il senso di rotazione possibile del canale protonico?

Patrizio
Moderatore

mago

Città: Barcellona


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Inserito il - 12 aprile 2007 : 17:53:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao compà...volevo chiderti dove hai letto le definizioni delle componenti Fo-F1 che hai scritto?


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kiko74
Nuovo Arrivato


Prov.: Napoli
Città: NApoli


4 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 19:45:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kiko74 Invia a kiko74 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La maggioranza delle notizie le ho prese dallo Sryer ma non direi che sono delle definizioni piuttosto descrivo un po a sommi capi la struttura ed alcune funzioni ad esso associate. Ad ogni modo il quesito riguarda il tipo di rotazione .
Sullo strayer dice che il flusso protonico è possibile unicamente nel verso orario però ruotando in questo modo la sintesi di ATP non dovrebbe essere favorita considerando che il moto orario viene trasmesso allo stelo centrale (costituito dalle subunita epsilon e gamma) ... beh non riesco a capire...qualcuno sa aiutarmi?
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Patrizio
Moderatore

mago

Città: Barcellona


1914 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 20:38:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora:
la sub unita' a non e' legata alla subunita' c poiche' dev essere libera di ruotare e qui l ambiente lipidico in cui si trova e' di notevole importanza,
non esistono semicanali ma l unico canale protonico e' quello della sub unita' a che permette il flusso di protoni dallo spazio intermembrana all interno della matrice (con un immagine si capirebbe meglio ma ora non ce l ho),i protoni passano per la a legano i residui di aspardato dei domini alfa elica delle c che quindi ruota e fuoriescono sempre dalla a,quindi la sub unita' gamma ruota nello statore(F1)poiche' e' legata alla c in senso orario
Diciamo che fisiologicamente il verso orario e' quello che permette la sintesi di ATP sfruttando il gradiente elettrochimico,in assenza di questo lo "stelo" gira in senso antiorario e idrolizza ATP.... infatti questo fu visto con l esperimento dell actina legata alla subunita' gamma associata al fluoroforo
questo e' quanto so io ,e spero di esserti stato utile


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Patrizio
Moderatore

mago

Città: Barcellona


1914 Messaggi

Inserito il - 12 aprile 2007 : 20:49:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
mi correggo,forse si possono chiamare semicanali


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kiko74
Nuovo Arrivato


Prov.: Napoli
Città: NApoli


4 Messaggi

Inserito il - 13 aprile 2007 : 10:41:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kiko74 Invia a kiko74 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh grazie per il tuo aiuto.
Rileggendo più attentamente mi risultavano due sensi opposti di totazione perchè le prospettive che consideravo erano diverse (cioè una dall'alto l'altra dal basso) quindi ho fatto un pò di confusione.
Riguardo alla subunità a è più giusto dire che è in contatto con le subunità c del canale protonico.


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Patrizio
Moderatore

mago

Città: Barcellona


1914 Messaggi

Inserito il - 13 aprile 2007 : 18:10:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Patrizio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Patrizio Invia a Patrizio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si ma dire in contatto non e' uguale a dire lega...e la c non ha nessun canale protonico!
cmq se ti e' chiaro il meccanismo va bene cosi'


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