paolo865
Utente Junior
Prov.: Como
Città: Olgiate Comasco
262 Messaggi |
Inserito il - 07 gennaio 2008 : 16:55:18
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I Vntr sono polimorfismi di 6-60 pb in tandem, dispersi non uniformemente nel genoma, ma nelle zone peritelomeriche. La loro informatività è data dalle numerose varianti alleliche (data dal diverso numero di ripetizioni in tandem), ma essa è diminuita a causa della loro distribuzione non uniforme nel genoma dal fatto che per le loro dimensioni (>40 kb) non possono essere rilevabili per PCR ma solo tramite SOuthern Blot. Gli STR (microsatelliti) invece sono ripetizioni in tandem di 2-4 pb, disperse uniformemente nel genoma ogni 20 Kb circa. Possono essere rilevati per PCR e sono molto informativi. L'unico problema è dato dallo slippage della taq polimerasi che può rendere difficile la loro genotipizzazione. Per Rilevare pe PCR un STR, basta usare dei primer per le sequenze fiancheggianti le ripetizioni in tandem, di solito in corrispondenza di siti di restrizione (si possono progettare degli anchored primer per esempio). spero di essere stato utile ciao |
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