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Patrizio
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Città: Barcellona
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 Inserito il - 08 gennaio 2008 : 20:12:25
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Usata per genotipizzare una variazione genetica e soprattutto rilevare e identificare SNPs,se in un certo locus e' presente una variazione puntiforme
si usano i Primer ASO (oligonucleotidi allele specifici),ne vengono disegnati 3 in tutto di cui 2 foreward e uno revers comune,i foreward presenteranno l ultimo nucleotide diverso che sara' uguale alla mutazione puntiforme....vengono poi assemblate 2 reazioni di PCR indipendenti con lo stesso DNA e identiche condizioni! molto stringenti,ma con i 2 primer diversi ora:
-Se il DNA e' omozigote,ibridera' solo con uno dei 2 primer forward...quindi si osserva solo la banda della PCR positiva e l altra ovviamente sara' negativa ( non c'e' appaiamento TARGET /PRIME )
-Se il DNA e' eterozigote entrambi le reazoini produrranno un amplificato anche se la banda sara' meno intenza
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PCR allele specifica.
