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maia84
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43 Messaggi |
Inserito il - 13 gennaio 2008 : 17:48:04
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Ciao a tutti!Ho un quesito da porvi...Come rispondereste a questa domanda? Avete isolato un clone di cDNA. L’avete sequenziato e trovato che è lungo 850 pb ed alla fine possiede una coda di poliA e segnale di poliadenilazione. Mediante Northern blot avete trovato che ci sono due bande una di 1.8 e l’altra di 2.4 Kb. Quali spiegazioni potete dare al fatto che vengono riconosciute 2 bande? Fate delle ipotesi. Sono sicura che riceverò tante risposte... 
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Aureus
Utente Junior


Prov.: Forlì-Cesena
Città: Gambettola
123 Messaggi |
Inserito il - 13 gennaio 2008 : 19:18:59
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Secondo me il motivo può essere che il Nortern blot non è stato fatto in condizioni denaturanti e perciò si sono formate strutture secondarie. Che ne dite? |
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Tecnici di Laboratorio Biomedico Lorenzo Nardi |
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MirrorHole
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14 Messaggi |
Inserito il - 13 gennaio 2008 : 19:51:25
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Citazione: Messaggio inserito da Aureus
Secondo me il motivo può essere che il Nortern blot non è stato fatto in condizioni denaturanti e perciò si sono formate strutture secondarie. Che ne dite?
Premetto che non me ne intendo molto...non vorrei dire una grossa boiata...ma ammesso che l'elettroforesi non sia stata fatta in condizioni denaturanti, secondo me a parità di lunghezza una molecola di RNA in cui si siano formate strutture secondarie, poichè più compatta, migra più velocemente della corrispettiva molecola a struttura distesa... |
...accendere una candela è gettare un'ombra... |
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maia84
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43 Messaggi |
Inserito il - 13 gennaio 2008 : 21:11:47
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Non credo,le condizioni devono essere denaturanti..Non potrebbe dipendere dal fatto che un gene può avere piu' siti di inizio per la trascrizione? Cosa ne pensate? |
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MirrorHole
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14 Messaggi |
Inserito il - 13 gennaio 2008 : 22:25:49
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Citazione: Messaggio inserito da maia84
Non credo,le condizioni devono essere denaturanti..Non potrebbe dipendere dal fatto che un gene può avere piu' siti di inizio per la trascrizione? Cosa ne pensate?
Credo sia possibile...è altrettanto probabile che l'RNA in esame per splicing alternativo o poliadenilazione alternativa possa dare mRNA di lunghezza diversa... |
...accendere una candela è gettare un'ombra... |
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Aureus
Utente Junior


Prov.: Forlì-Cesena
Città: Gambettola
123 Messaggi |
Inserito il - 14 gennaio 2008 : 14:50:17
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Sono curioso, qual'è il gene del tuo inserto? Ma tu il Northern blot l'hai fatto in condizioni denaturanti? Ne siete proprio sicuri che non dipende da isoforme diverse di RNA che danno strutture secondarie? http://it.wikipedia.org/wiki/Northern_blot
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maia84
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43 Messaggi |
Inserito il - 14 gennaio 2008 : 17:19:10
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Non conosco il gene. Ma sono sicura che le sequenze vengano fatte correre su un gel in condizioni denaturanti. |
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