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 coeff. di coiencidenza e frequenze attese
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daisy
Nuovo Arrivato

Prov.: Asti
Città: asti


108 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2008 : 20:51:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di daisy Invia a daisy un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao...Viene fatto il seguente incrocio il Drosophila:

a + b/+ c + X a c b/y

Calcola il numero di individui attesi nelle diverse classi fenotipiche nei maschi e nelle femmine sapendo che la distanza tra i geni a e c è 14um, quella tra c e b è 12um, il coeff. di coincidenza è 0,3 e il totale della progenie è 2000.


Dalla soluzione non spiegata però, ottengo questi risultati:
Il punto di partenza è di utilizzare il valore del coeff di coincidenza per calcolare il numero dei doppi ricombinati. Una volta calcolato questo valore (si fa 1-0,3 = o,7 ricombinanti e poi...?), si utilizzano le distanza di mappa per calcolare il numero di singoli ricombinati per ciascuna classe (questo è come per il dottor spock, vero GFPina?). Sia i maschi che le femmine sono distribuiti come segue:

a + b  372
+ c +  373
a c +   67
+ + b   68
a + +   57
+ c b   58
a c b    2
+ + +    3


Non riesco proprio a capire con quale calcolo ottenga le frequenze attese...è tutta la mattina che ci provo .. grazie

e@daisy

GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 06 febbraio 2008 : 01:55:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora le frequenze attese le ottieni esattamente come negli esercizi precedenti! Sono le frequenze che avresti se non ci fosse interferenza.

Quindi la frequenza attesa dei doppi ricombinanti è data da:
fr D.R. att = 14% x 12% = 1.68% = 0,0168

Non sto a calcolarti le altre perché sono esattamente come per gli altri esercizi.

Il coefficiente di coincidenza è il rapporto tra le frequenze osservate e le frequenze attese dei doppi ricombinanti:

c = fr.DR oss/fr.DR att

quello che hai calcolato tu è l'Interferenza:
I = 1-c = 1 - 0,3 = 0,7
che però non ti serve!

Hai calcolato la frequenza attesa dei doppi ricombinanti, conosci il coefficiente di coincidenza, quindi dalla formula ricavi la frequenza osservata dei doppi ricombinanti:

c = fr.DR oss/fr.DR att
fr.DR oss = c x fr.DR att = 0,3 x 0,0168 = 0,005

da questa calcoli i doppi ricombinanti osservati su 2000 individui
D.R. = 0,005 x 2000 = 10

Attenzione però la progenie che hai indicato tu (non so se è il risultato che ti davano dell'esercizio) è di 1000 individui (non 2000!) perché saranno 1000 femmine e 1000 maschi.
Comunque a questo punto ti calcoli gli individui osservati (su 1000).
I doppi ricombinanti saranno: 0,005 x 1000 = 5
infatti tra i risultati hai:
a c b 2
+ + + 3 (2+3=5)

e poi usi le distanze di mappa e questa frequenza dei doppi ricombinanti osservati per calcolarti i ricombinati singoli!

Chiaro adesso?

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valgenetica
Nuovo Arrivato



2 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2009 : 18:43:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di valgenetica Invia a valgenetica un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sn una nuova iscritta alle prese cn la genetica...mi intrometto in questa discussione xkè mi è capitato un esercizio molto simile...volevo chiederti se era possibile calcolare le frequenze anche se nell'esercizio non viene dato il coefficiente di coincidenza e neanche il numero totale della progenie.grazie mille.
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2009 : 19:34:37  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si certo che puoi!
Innanzitutto se non ti dà il coefficiente di coincidenza vuol dire che non c'è interferenza ed è tutto più semplice.
Se anche non hai il numero totale della progenie non cambia niente, le "frequenze" che sono espresse in frequenza 0,... (con massima frequenza = 1) o in percentuale le puoi calcolare.

Comunque è spiegato tutto nel dettaglio qui: Problema: il sig spock e le distanze di mappa

Poi se cerchi un po' ci sono anche molti esercizi di questo tipo in questa sezione!

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