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orcaimpetuosa
Utente Junior
234 Messaggi |
 Inserito il - 08 aprile 2008 : 22:03:49
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beh, urgente... entro domattina.
in che modo si decide la precentuale di un gel di acrilammide conoscendo la massa della proteinache ho intenzione di separare?
se l'avete sono interessato anche a riferimenti bibliografici
grazie mille
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valia
Moderatore
Prov.: UK
1001 Messaggi |
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orcaimpetuosa
Utente Junior
234 Messaggi |
Inserito il - 08 aprile 2008 : 22:33:47
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buono, ma non c'è. che ne so, un calcolo da fare per conoscere con precisione la concentrazione ottimale?
e poi un'altra cosa:
per i gel a gradiente, come lo decido? conoscendo la % ottimale faccioin modo che questa sia verso la fine del mio gradiente? |
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darkene
Utente Junior
291 Messaggi |
Inserito il - 08 aprile 2008 : 22:38:06
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no, a metà.
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darkene
Utente Junior
291 Messaggi |
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orcaimpetuosa
Utente Junior
234 Messaggi |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 09 aprile 2008 : 00:35:43
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| Per queste cose ti conviene partire da un'approssimazione (es. l'ultimo link che ti ha scritto darkene) e provare, in caso cambi leggermente le %, ma come vedi i range di separazione sono piuttosto ampi, quindi non ci dovrebbero essere molti problemi. |
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orcaimpetuosa
Utente Junior
234 Messaggi |
Inserito il - 09 aprile 2008 : 01:24:59
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eheh in teoria...
in realtà la mia domanda è puramente teorica però la proteina che stiamo cercando comigra perfettamente con un'altra |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 09 aprile 2008 : 03:17:14
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| beh, allora forse potresti pensare ad un approccio differente. Ad es. una cromatografia su colonna, magari derivatizzata con anticorpi per la tua proteina? |
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orcaimpetuosa
Utente Junior
234 Messaggi |
Inserito il - 10 aprile 2008 : 00:36:17
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è proprio quello che stiamo pensando.
infatti nella sezione bioinformatica chiedo anche se qualcuno conosce dei tools per disegnare un peptide che funga da antigene per la proteina che cerchiamo, perchè appunto è difficile purificarla.
pensa che stiamo facendo dei gel "giganti", nella struttura che veniva usata per fare i primi sequenziamenti di dna, e corrono anche per 3 o 4 giorni... pazzesco! |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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orcaimpetuosa
Utente Junior
234 Messaggi |
Inserito il - 13 aprile 2008 : 14:15:43
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si si, ma siccome la proteina non è mai stata isolata, a questo punto abbiamo qualche dubbio sull'anticorpo che usiamo.
Con un peptide di sintesi saremmo sicuri della purezza.
Ora stiamo provando vari trattamenti per precipitare solo l'una o l'altra proteina |
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% acrilammide (urgente)
Didattica
