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SerenaS
Utente Junior
211 Messaggi |
 Inserito il - 04 giugno 2008 : 10:30:52
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Ciao a tutti,
sto studiando la struttura della DNA polimerasi 3 associata alla sua funzione di replicazione del DNA.
Volevo sapere:la pinza beta che sintetizza il filamento ritardato,una volta che finisce di sintetizzare un frammento di Okasaki, si stacca dal filamento stampo e quindi se ne ritrova poi una nuova all'inizio del successivo frammento di Okasaki.Giusto?
Inoltre,la pinza beta che si stacca dal filamento stampo dopo aver completato il frammento di Okasaki è una unità a sè stante?cioè rimane libera dopo il distacco e si va poi a legare all'inizio del successivo frammento di Okasaki?, oppure rimane strutturalmente legata al complesso gamma delta(al resto della struttura della DNA polimerasi),e poi assieme a questo complesso,viene portata al sito di inizio del successivo frammento di Okasaki?
Spero di essere stata chiara.Il fatto è che sul GENE VIII c'è scritto che la pinza beta si distacca e rimane come una entità strutturalmente libera e poi si va a legare all'inizio del nuova frammento di Okasaki, mentre su questa slides http://users.unimi.it/popolo/Lez%206%20-%20Replicazione%20DNA.pdf (pagg.28-29-30) come potete vedere la pinza beta rimane legata strutturalmente al resto del complesso della DNA polimerasi.
Qualcuno risolva il mio dubbio please
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AmbienteLife
Utente Junior
Prov.: Bari
Città: Bari
204 Messaggi |
Inserito il - 04 giugno 2008 : 15:07:27
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Ciaooo allora questo ti chiarirà le cose spero.... la DNA polimerasi 3 (abbrevio con pol3) è formata de 3 parti con 3 attività differenti:
1)Parte superiore: che possiede le due DNA polimerasi che materialmente effettuano la sintesi del DNA
2)Parte intermedia: detto LOADER o CARICATORE della pinza (la pinza si dice spesso anche sliding clamp letteralmente pinza scorrevole)
3)Parte inferiore: la pinza (sliding clamp)
Voglio attirare la tua attenzione al punto due ovvero il LOADER, la pinza viene caricata proprio grazie a questa parte della proteina che idrolizzando ATP (ATP --> ADP + P) apre la pinza la inserisce a livello del DNA e la richiude. Se il loader dovesse venire meno, la pinza NON HA ALCUN MODO DI ESSERE CARICATA, in definitiva necessariamente la pinza deve rimanere attaccata al complesso enzimatico. In definitiva trova il primer, sintetizza DNA, trovato l'altro primer si stacca e "torna indietro", (questo non è molto corretto, non so se hai fatto il MODELLO A TROMBONE in effetti non è la pol3 che torna indietro ma il DNA che forma un'ansa) viene idrolizzata un'altra molecola di ATP l'anello GRAZIE AL LOADER si apre e si richiude intorno al DNA.
Spero di esser stato chiaro :-D fammi sapere
Chrys |
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SerenaS
Utente Junior
211 Messaggi |
Inserito il - 04 giugno 2008 : 17:22:14
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OK ho capito cosa vuoi dire..che il loader o cmq l'intera struttura si muove lungo la molecola del DNA e la pinza si apre e si chiude ogni volta che trova un primer..quiindi la pinza rimane sempre legata all'intera struttura della polimerasi vero?
Sul GENE VIII invece ho trovato che la pinza si stacca ogni volta che finisce un frammento di okasaki, tutto il complesso della polimerasi si muove quindi in avanti per trovare l'altro primer e all'inizio dle secondo frammento di Okasaki che deve essere sintetizzato, trova la pinza già legata e quindi poi svolge la sua attività..quindi è come se la pinza, cioè le subunità beta venissero riciclate in un certo senso..mi sono spiegata?o meglio è il GEE VIII che spiega così
Fammi sapere se ho capito bene il tuo ragionamento
Grazie mille |
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AmbienteLife
Utente Junior
Prov.: Bari
Città: Bari
204 Messaggi |
Inserito il - 04 giugno 2008 : 19:01:29
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Ciao, si si ho capito... comunque no no, la pinza non si lega da sola, tieni conto che si deve aprire e chiudere, non può farlo autonomamente, per una questione biochimica ci deve essere qualcosa che causi la modificazione conformazionale della proteina (pinza), in questo caso è il loader che idrolizzando ATP apre l'anello e poi lo richiude. Infatti per sintetizzare il filamento lento, è necessaria una grande quantità di ATP se consideri che ogni volta che l'anelloo si stacca e riattacca, viene consumata una molecola, questo non a caso, proprio per dirti come non è possibile che l'anello si trovi già legato  Comunque ho visto il file da cui studi, è identico al mio, cioè al mio file dal quale sto studiando biologia molecolare, le immagini sono affidabili te lo posso assicurare  .
Chrys |
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SerenaS
Utente Junior
211 Messaggi |
Inserito il - 04 giugno 2008 : 20:51:42
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OK
Grazie mille
In bocca al lupo anche per il tuo esame allora
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AmbienteLife
Utente Junior
Prov.: Bari
Città: Bari
204 Messaggi |
Inserito il - 04 giugno 2008 : 22:20:35
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| crepi il lupo... spero di esserti stato d'aiuto ciao |
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