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Discussione |
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sefossiacqua
Nuovo Arrivato
Prov.: Palermo
Città: Palermo
8 Messaggi |
 Inserito il - 06 giugno 2008 : 22:06:28
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Qualcuno mi spiega cosa sono i miRNA???   AIUTOOO mi serve giusto un accenno per la tesi...grazie 
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so di non sapere... |
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Schuldiner86
Utente Junior
Prov.: Viterbo
Città: Bologna
581 Messaggi |
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la_fra
Utente
750 Messaggi |
 Inserito il - 06 giugno 2008 : 22:23:25
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| sono piccoli RNA, di circa 22 nt, che agiscono a livello post-trascrizionale andando a modulare la traduzione di determinati mRNA. infatti non vi si appaiano in maniera del tutto complementare ma il loro legame al 3'UTR dell'mRNA target ne causa il blocco della traduzione. i siRNA (silencing RNA) invece sono perfettamente complementari e si appaiano formando un RNA a doppio filamento che viene degradato (meccanismo di difesa della cellula contro i dsRNA virali). ultimamente è stato scoperto un ruolo importante dei miRNA nella tumorigenesi perchè, dato il loro ruolo regolatorio in molte neoplasie, la loro deregolazione porta la cellula tumorale ad evadere l'apoptosi, proliferare in modo incontrollato e così via,quindi potrebbero diventare anche un marker prognostico |
Doctors are men who prescribe medicines of which they know little, to cure diseases of which they know less, in human beings of whom they know nothing (Voltaire) |
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la_fra
Utente
750 Messaggi |
Inserito il - 06 giugno 2008 : 22:25:25
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| scusa ho dimenticato di scrivere che i miRNA però sono endogeni, presenti nelle regioni non coding, i siRNA no |
Doctors are men who prescribe medicines of which they know little, to cure diseases of which they know less, in human beings of whom they know nothing (Voltaire) |
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sefossiacqua
Nuovo Arrivato
Prov.: Palermo
Città: Palermo
8 Messaggi |
Inserito il - 09 giugno 2008 : 08:09:38
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| e' tutto più chiaro adesso. Grazie!! |
so di non sapere... |
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Zea
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
Inserito il - 20 giugno 2008 : 12:32:26
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Posso chiedervi anch'io una cosa? ma sia nel caso di siRNA che di miRNA si parla comunque di RNAi?
grazie mille per il chiarimento! |
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gianpierolandolfi
Nuovo Arrivato
84 Messaggi |
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 20 giugno 2008 : 14:48:21
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La risposta è sì.
L'RNAi è una pathway molecolare unica, ma può processare diversi tipi di RNA (dsRNA, shRNA, miRNA)
generando blocco traduzionale in diversi modi (degradazione, blocco irreversibile, blocco reversibile)
ma sempre di pathway dell'RNAi si tratta!
Una prova? il fatto che overesprimendo shRNA si rischia di 'intasare' il sistema endogeno
della cellula, basato sui miRNA, attraverso il quale regola l'espressione genica fisiologica.
Questo perchè il sistema è uno solo ed è in comune. |
Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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Zea
Nuovo Arrivato
6 Messaggi |
Inserito il - 20 giugno 2008 : 22:18:04
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Grazie mille del chiarimento Dionysos!!  |
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mr writer
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
Inserito il - 22 giugno 2008 : 10:46:25
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| Ma gli miRNA sono a singola o a doppia elica? |
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 22 giugno 2008 : 12:48:57
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Guarda su wikipedia: sono filamenti singoli che formano strutture
a forcina intramolecolari, con aspetto a doppia elica.
Il taglio di Dicer li priva del loop che unisce i due emifilamenti
appaiati, rendendoli sostanzialmente due filamenti separati e
appaiati (quindi il prodotto finale funzionale è un piccolo dsRNA) |
Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 23 giugno 2008 : 00:47:37
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Citazione:
Messaggio inserito da Dionysos
Il taglio di Dicer li priva del loop che unisce i due emifilamenti
appaiati, rendendoli sostanzialmente due filamenti separati e
appaiati (quindi il prodotto finale funzionale è un piccolo dsRNA)
Non sono molto d'accordo su questo!
E' vero che il Dicer taglia il loop e rimangono due fialmenti complementari appaiati (miRNA/miRNA*) ma questo non è ancora il miRNA maturo, il miRNA maturo è a singolo filamento! Viene rimosso il filamento miRNA* (Passenger strand) e rimane solo il filamento miRNA (Guide strand). Poi se vuoi dire che il miRNA è attaccato al RISC, Dionysos, posso anche essere d'accordo! Ma di fatto quello "maturo" è quello a singolo filamento!
(immagine da: MicroRNA Biogenesis: Drosha Can't Cut It without a Partner)
Comunque anche su Wikipedia lo dice:
MicroRNA
Le review che ho io non sono free e non posso metterle, ma quella da cui ho preso questa figura è free!
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 23 giugno 2008 : 02:25:28
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Sai una cosa..
la mia affermazione era influenzata dal parallelismo con i siRNA:
di fatto si parla di "siRNA maturi" quando il passenger strand del siRNA
(anche per loro si chiama così) è ancora appaiato al filamento guida
mentre a seguito dell'incorporazione del filamento guida nel RISC si parla
di "complesso siRISC" , così come ho sentito parlare di "complesso miRISC",
perchè non esistono miRNA single strand 'liberi', visto che l'unwinding avviene
proprio ad opera delle argonauts all'interno del RISC e non prima.
Adesso non ho qui gli articoli da scrutare/citare, ma sono
sicuro che tutte queste cose le conosci già benissimo 
Riguardo la storia del miRNA "maturo" oppure no...
Dall'immagine che hai postato, e quindi dal corrispondente articolo,
mi viene da pensare che non c'è concordanza di opinioni su cosa sia
definibile come "miRNA maturo". Secondo quello che si legge altrove
il miRNA è tale - cioè non più un pre-miRNA- a partire dal taglio
di dicer in poi. Certamente non è ancora funzionale, perchè fino a
che il passenger non si leva di mezzo non può fare il suo lavoro,
ma non so dirti se è corretto o no l'uso della parola "maturo"
visto che comunque non è più pre-miRNA, ma non è ancora attivo!
A 'sto punti direi che si tratta di un discorso di natura puramente
terminologica: di fatto siamo d'accordo su quali siani gli avvenimenti!
Per rispondere alla domanda iniziale in modo completo bisognerebbe dire:
Citazione:
Ma gli miRNA sono a singola o a doppia elica?
- i miRNA sono prodotti come singolo filamento stem-loop (pri-miRNA e poi pre-miRNA)
- i miRNA sono transitoriamente processati a intermedi a doppio filamento (chiamali come vuoi)
- i miRNA esplicano la loro funzione come singolo filamento (nell'ambito del complesso miRISC)
va bene così? |
Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 23 giugno 2008 : 20:10:31
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Si beh sicuramente è un discorso di terminologia, il processo biosintetico è quello e siamo d'accordo!
Non vorrei che questa discussione però si dilungasse troppo sulla "terminologia" (come successo per altre discussioni  ).
Quello che ti posso dire è che ho sempre sentito parlare di miRNA come "singolo filamento" (anche se uno degli intermedi è a doppio)
Ovviamente come ho già detto gli articoli che possiedo non sono free e non posso allegarli, però in questo:
Approaches to microRNA discovery
c'è una definizione di miRNA che... penso che tradotta e leggermente accorciata posso citare:
Citazione:
Definizione classica di miRNA
I miRNAs sono definiti come RNA non codificanti che rispettano questi criteri:
1) Un miRNA maturo dovrebbe essere espresso come un trascritto distinto di ~22 nt individuabile mediante Northern blot (o altri metodi utilizzati normalmente per identificare RNA)
2) Un miRNA maturo dovrebbe originare da un precursore con una struttura secondaria caratteristica (ad. es hairpin) e dovrebbe trovarsi nella parte appaiata (stem) del precursore.
3) Un miRNA maturo dovrebbe venire processato da Dicer
4) (criterio opzionale ma comunemente utilizzato) La sequenza del miRNA maturo e la struttura dell’hairpin dovrebbero essere conservate in diverse specie.
Ci possono essere delle variazioni, ma le prime 2 condizioni sono necessarie per poter classificare una sequenza come miRNA.
Va beh comunque per complicare le cose... aggiungo anche che:
- i miRNA possono appaiarsi "completamente" o "parzialmente" all'mRNA target, se l'appaiamento è completo l'mRNA viene degradato, se è parziale si ha solo il blocco della traduzione (dovrei cercare review o articoli che lo dicono, perchè al momento non li ho sottomano!)
- è stato scoperto che anche se normalmente i miRNA funzionano impedendo la traduzione in alcuni casi possono "attivarla"!!!
When microRNA activate translation - Nature Methods Vol.5 No.2 Febr 2008 pg. 1223-3 (ovviamente non free, ma ho qua la copia cartacea della rivista), si riferisce a questo articolo:
Switching from repression to activation: microRNAs can up-regulate translation. (ovviamente però neanche questo è free!!!)
Da questo si capisce che i meccanismi di regolazione della cellula sono ben complessi... e secondo me ne sappiamo ancora veramente poco!!!
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Crystal85
Nuovo Arrivato
11 Messaggi |
Inserito il - 15 luglio 2008 : 23:23:32
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| ci sono anche i piRNAs (Piwi-associated RNAs). piwi è una proteina coinvolta nella linea germinale. Si presentano come molecole a singolo filamento di 24-29 nucleotidi. |
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miRNA
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