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Autore Discussione  

Mailen
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4 Messaggi
Inserito il - 21 settembre 2008 : 18:00:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Mailen Invia a Mailen un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao... ricordo che su NCBI c'è un modo per comparare sequenze genice tra specie diverse... ovvero io inserisco il gene dell'emoglobina umana e mi vien fuori il gene e le regioni omologe di specie diverse a partire da quella più vicina fino a qiuella più lontana... mi capite??? Riuscite ad aiutarmi????
Grazie

memole
Utente Junior

memole

Prov.: Brindisi
Città: brindisi


577 Messaggi
Inserito il - 21 settembre 2008 : 18:29:38  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di memole Invia a memole un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ti stai per caso riferendo alla possibilità di fare un blast?
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Mailen
Nuovo Arrivato




4 Messaggi
Inserito il - 21 settembre 2008 : 18:35:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Mailen Invia a Mailen un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok... scusami ho già fatto... solo che ho difficoltà ad interpretare gli score... tra due seq proteiche ho uno score dell'80,2.... che significa??? è in percentuale????
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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 21 settembre 2008 : 21:37:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Quanto é urgente questa domanda? Cosa devi fare esattamente? Stai risolvendo un esercizio o ti serve per dei risultati in laboratorio?
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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Mailen
Nuovo Arrivato




4 Messaggi
Inserito il - 22 settembre 2008 : 11:30:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Mailen Invia a Mailen un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
E' solo un esercizio... ma prima capisco meglio è... volevo confrontare la sequenza della catena A dell'emoglobina umana con quella di pesce... e quello è lo score risultante da blast... però non capisco se è alto o meno... ma mi sa che non è un buon punteggio... perchè confrontando due seq identiche mi dava uno score di 250 circa...e gli amminoacidi uguali non erano moltissimi... è solo per avere un'idea:-)
Ciao ciao
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