| Autore |
Discussione |
|
|
roberta.s
Utente Junior
Città: Parigi
564 Messaggi |
 Inserito il - 15 maggio 2012 : 17:32:43
|
Ciao a tutti, qualcuno saprebbe indicarmi un programma per analizzare dati di ChIP on chip e come paragonare l'enrichment per una data regione in due microarray?
Ho fatto l'esperimento su Microarray Agilent, estratto i dati con GenePix e ottenuto i miei file excel. Vorrei adesso analizzare questi dati, ma non ho idea di come fare. Vorrei sapere come visualizzare le varie sonde sul genoma, come definire se un sito è statisticamente arricchito o no (=qual è la soglia che devo scegliere? log2 (ratio) >0?) e cosi' via.
Grazie a tutti in anticipo
|
|
|
|
|
chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
|
|
roberta.s
Utente Junior
Città: Parigi
564 Messaggi |
Inserito il - 15 maggio 2012 : 18:27:20
|
è che in bioconductor si trovano vari pacchetti. ieri ho provato a scaricarne uno, ma essenzialmente non accetta il formato con cui ho effettuato lo scanning della slide ...
|
 |
|
|
chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
|
| |
Discussione |
|
ChIP on chip: analisi dati
Guide tools online
