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xgabrix
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82 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2012 : 18:29:26

Ciao Gente...:) sto facendo una ricerca bioinformatica e sto lavoramndo su un multiallineamento che ho eseguito con clustalW2, la applicazione presente su internet. Adesso per� vorrei visualizzare meglio il multiallineamento utilizzando Consurf, il quale mi chiede di caricare il multiallineamento in uno dei 7 formati da lui riconosciuti, tra cui anche Clustal...solo che non riesco a scaricare il multiallineamento in formato clustal..voi sapete come si fa? Ho provato a copiare e incollare l'allineamneto risultante su textedit ma nn lo riconosce.

Ciao Gente!!!

GRazie!

stefanken
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39 Messaggi

Inserito il - 26 novembre 2012 : 14:13:36

Ciao,
allora, dando per scontato che hai utilizzato la versione online su EBI di clustalW, dovresti solo cliccare sul tasto Download Alignment File e salvare quanto ottieni con l'estensione aln.
Spero sia questo il tuo problema, se cos� non fosse potresti fornire altri dettagli?
Ciao!
Stefano

MB
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58 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2012 : 15:19:55

Si devi andare su download alignment.. per formato clustal s'intende com'� formattato il testo all'interno del file..l'estensione pu� essere anche diversa da .clustal

Usi Consurf, anch'io ho dovuto usarlo recentemente, posso sapere perch� hai deciso di allineare tu? Che necessit� avevi?

ciauz