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hiero
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28 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2013 : 18:29:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di hiero Invia a hiero un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
un attimo, forse ho capito... in questo caso l'ordine deve essere per forza
c---y---b, così ci troviamo!
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2013 : 19:27:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Perché ti stai facendo questi problemi inutili?
Devi semplicemente stabilire qual è il gene centrale, poi chi sta a sinistra o a destra è assolutamente indifferente! Dipende solo da che parte lo guardi, è come dire una volta stabilito che Roma sta in mezzo che l'ordine è Milano - Roma - Napoli piuttosto che Napoli - Roma - Milano, dipende se parti da nord o da sud!
Chiamare SCI o SCII uno o piuttosto che l'altro è una convenzione una volta che hai segnato un ordine, solo per intendersi ma è assolutamente indifferente!
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hiero
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28 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2013 : 23:15:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di hiero Invia a hiero un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si, ma se mi devo calcolare la distanza fra i vari geni mi serve sapere quali ricombinano fra il primo e il secondo e fra il secondo e il terzo gene, giusto? Ci sono alcuni esercizi che mi fanno bloccare su questa cosa e non mi fanno andare avanti... tipo questo

Immagine:

112,07 KB


allora, riconosco i parentali e i doppi ricombinanti e dal loro confronto ottengo l'informazione che l'ordine dei geni è pr a bm. a questo punto per calcolarmi la distanza tra pr ed a devo trovare i singoli ricombinanti tra pr-a e qui mi blocco.

sono per caso a+ pr+ bm, a pr bm+ ?
e quelli fra a-bm sono a+ pr bm, a pr+ bm+?
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JGuardaGliUfo
Utente

Mafalda

Città: Roma


641 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2013 : 00:13:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di JGuardaGliUfo Invia a JGuardaGliUfo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Non capisco cosa ti blocca. Io non sono laureata in Biologia o simili e forse le mie spiegazioni non sono approfondite o precissime, però quelle di GFPina sono super. Quindi, ricapitolando:

Citazione:
si, ma se mi devo calcolare la distanza fra i vari geni mi serve sapere quali ricombinano fra il primo e il secondo e fra il secondo e il terzo gene, giusto?


Questo lo abbiamo appurato. Per essere rudi e banali: se al'esame ti capita un esercizio in cui devi determinare l'ordine dei geni a b c, ammettendo che c sia quello centrale, scrivere a-c-b o b-c-a è lo stesso, il tuo Professore non ti boccerà perchè, ripetiamo, sono la stessa identica cosa.

Chiariscimi una cosa:

Citazione:
a questo punto per calcolarmi la distanza tra pr ed a devo trovare i singoli ricombinanti tra pr-a e qui mi blocco.


Dove ti blocchi? Se hai capito come avviene il crossing over non ti devi bloccare.

Ancora:

Citazione:
sono per caso a+ pr+ bm, a pr bm+ ?
e quelli fra a-bm sono a+ pr bm, a pr+ bm+?


Quelli tra a-bm sono pr+ a bm e pr a+ bm+, dove li hai presi quelli che hai scritto? Non ho capito, onestamente, con quale "metodo" determini i ricombinanti singoli, ma non serve fare nulla di trascendentale: basta ordinare i geni, prendere i parentali (ordinati) e simulare un crossing over.

I could not love except where Death
Was mingling his with Beauty’s breath —
Or Hymen, Time, and Destiny
Were stalking between her and me.

E. A. Poe
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2013 : 01:12:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ti faccio un esempio con ABC e con numeri molto semplici perché è più facile da visualizzare.
Hai ad es. questi dati:
BCA 30
bcA  8
BcA 11
Bca  2
bCa 13
BCa  6
bca 26
bCA  4

Quello che devi fare è questo (in questi ordine):
1) trovi i parentali (i più frequenti) e i doppi ricombinanti (i meno frequenti)
parentali: BCA 30 e bca 26
doppi ric: bCA  4 e Bca  2

li confronti e guardando cosa cambia stabilisci qual è il gene centrale.
In questo caso è B, quindi l'ordine è ABC (o BCA è uguale!)
2) ti "riscrivi" TUTTE le classi mettendo i geni in questo ordine:
(i li ho messi anche mettendoli a coppia per ogni classe)
ABC 30
abc 26
Abc 8
aBC 6
ABc 11
abC 13
AbC 4
aBc 2

Così è chiaro quali sono quelli che hanno avuto ricombinazione tra A e B (ScI in questo caso) e quelli che hanno avuto ricombinazione tra B e C (ScII)
Parentali   ric A-B    ric B-C
  ABC 30     Abc 8     ABc 11
  abc 26     aBC 6     abC 13

così ti sono chiari?
3) calcoli le distanze tra i geni:
A-B = (8 + 6 + 4 + 2)/100 = 0,2 = 20 u.m.
B-C = (11 + 13 + 4 + 2)/100 = 0,3 = 30 u.m.

tutto qua!
(ovviamente se metti l'ordine CBA ti viene la stessa identica cosa!)

Certo se i geni sono lettere diverse da ABC e "non li scrivi in ordine" è facile fare confusione, ma basta seguire un rafionamento logico e fare le cose con ordine che è impossibile sbagliare!

P.S. J. le tue spiegazioni sono ottime!
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hiero
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28 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2013 : 01:40:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di hiero Invia a hiero un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
pr+--- a----bm+'
...X.............. che mi da---> pr+ a+ bm, pr a bm+
pr----a+----bm


pr+---a-----bm
...........X......... che mi da pr+ a bm, pr a+ bm+
pr----a+----bm


pr+---a-----bm+
.....X.....X........ che mi da pr+ a+ bm+, pr a bm
pr----a+-----bm


i parentali sono i più numerosi
i DCO i meno numerosi
per quanto riguarda i singoli ricombinanti ne ho 4 diversi, come faccio ad associare a loro un determinato numero ?
Quale sco di quelli che ho ottenuto (nell'ordine giusto) conta 76 individui? E 181? E 69 ? 185?

per intenderci meglio
pr+ a+ bm conta 76 oppure 181 oppure 69 oppure 185 individui?
e così via con gli altri sco

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2013 : 02:09:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da hiero

Quale sco di quelli che ho ottenuto (nell'ordine giusto) conta 76 individui? E 181? E 69 ? 185?

per intenderci meglio
pr+ a+ bm conta 76 oppure 181 oppure 69 oppure 185 individui?
e così via con gli altri sco

Ma stai dando i numeri?
I numeri degli individui di ciascuna classe sono già scritti di fianco al loro rispettivo fenotipo, non è che li devi mischiare e riassegnare a casaccio!
a+ pr+ bm è 69 (c'è scritto nel testo!)
se anche ordini i geni e lo scrivi come pr+ a+ bm sempre 69 sono! Mica cambiano!
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