| Autore |
Discussione |
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
 Inserito il - 01 febbraio 2013 : 01:24:26
|
ciao a tutti ragazzi, vi porpongo 2 esercizi che a me per un motivo o per un altro non escono:
1) il seguente è un esempio di mappa di associazione tra tre geni (a,b,c) posti sullo stesso autosoma di una certa specie
A-------B----------C
12um 16um
Se il coefficiente di coincidenza fosse 1 determinare le frequenze dei fenotipi attesi derivati da un incrocio abc/+++ X abc/abc. E se il coefficiente di coincidenza fosse 0.40?e se l'incrocio fosse +b+/a+c X abc/abc considerando un coefficiente di coincidenza pari a 1?
2) in Drosophila è stato effettuato un incrocio tra femmine di fenotipo recessivo per 3 geni: sc s v con maschi di fenotipo selvatico.Tutte le femmine della F1 erano selvatiche e i maschi erano mutati per tutti e tre i geni. E' stata prodotta una F2 (incrociando maschi e femmine della F1)che ha dato le seguenti classi fenotipiche ddi una progenie di 1000 individui.
sc s v 314
+ + + 280
+ s v 150
sc + + 156
sc + v 46
+ s + 30
sc s + 10
+ + v 14
a) stabilite su quale cromosoma sono localizzati i 3 geni
b)stabilite i genotipi dei moscerini della generazione parentale e della F1
c) stabilite l'ordine dei tre deni e la distanza di mappa tra essi
d) calcolate il coefficiente di coincidenza e l'interferenza.
|
|
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 01 febbraio 2013 : 09:15:40
|
Benvenuto!
Non importa se gli esercizi alla fine non ti escono, scrivi comunque qui il tuo ragionamento, così potremo capire quali sono i tuoi dubbi e aiutarti a risolverli. |
 |
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 01 febbraio 2013 : 19:32:18
|
ESERCIZIO 1
non saprei come risolverlo nè come partire
ESERCIZIO 2
vorrei avere dei chiarimenti riguardo alcuni dubbi.
1)la progenie che viene elencata sono sempre i gameti dell'individuo eterozigote?
2)i fenotipi più numerosi sono sempre quelli parentali?
3)come faccio ad individuare i geni che ricombinano una volta nella regione fra il primo e il secondo gene e fra il secondo e il terzo?
4)i doppi ricombinanti sono sempre i due meno numerosi?
5) non so da dove partire per risolvere i punti a e b dell'esercizio
 scusate le mille domande ma sono abbastanza nei guai |
|
|
|
JGuardaGliUfo
Utente
Città: Roma
641 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2013 : 09:40:27
|
Per il primo esercizio prova a guardare questi link:
- http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=24589&SearchTerms=coefficiente,di,coincidenza
- http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=4600&SearchTerms=spock
Per quanto riguarda il secondo, provo a rispondere alle tue domande:
Citazione:
1)la progenie che viene elencata sono sempre i gameti dell'individuo eterozigote?
2)i fenotipi più numerosi sono sempre quelli parentali?
3)come faccio ad individuare i geni che ricombinano una volta nella regione fra il primo e il secondo gene e fra il secondo e il terzo?
4)i doppi ricombinanti sono sempre i due meno numerosi?
5) non so da dove partire per risolvere i punti a e b dell'esercizio
1) la progenie elencata.. è la progenie! Vengono riportati i fenotipi, di solito.
2) esatto!
3) devi prima determinare l'ordine dei geni e poi, molto semplicemente, osservi i crossing over.
4) di norma sì, ma possono anche non verificarsi doppi crossing over e la loro frequenza risulterebbe zero (questa è una eventualità valida anche per parentali o singoli ricombinanti, credo).
5) ovviamente, quando si chiede di stabilire il cromosoma su cui sono localizzati i geni, ti si chiede di indicare se sono su autosomi o cromosomi sessuali. Non ho guardato attentamente il testo o la progenie, però credo che puoi dedurlo anche solo dalla consegna dell'esercizio.
|
I could not love except where Death
Was mingling his with Beauty’s breath —
Or Hymen, Time, and Destiny
Were stalking between her and me.
E. A. Poe |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2013 : 11:12:31
|
Ti consiglio di andare a vederti i link indicati da JGuardaGliUfo, iniziando dal secondo che è un caso senza interferenza e poi dal primo dove si parla anche di interferenza. È spiegato tutto passo per passo.
Poi torna pure qui e prova a risolvere questi, saremo qui a darti una mano.
|
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2013 : 20:49:26
|
ESERCIZIO 1
---- CDC=1 --- CDC=0,40
ABC 37% --- 36,4%
+++ 37% --- 36,4%
A++ 5% --- 5,6%
+BC 5% --- 5,6%
AB+ 7% --- 7,6%
++C 7% --- 7,6%
A+C 0.96% --- 0,38%
+BC 0.96% --- 0,38%
spero siano giusti :( , per quanto riguarda il terzo punto del primo esercizio non so da dove partire inquanto mi danno un altro incrocio e come punti noti soltanto il cdc! |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2013 : 21:30:31
|
esercizio 2
mi chiedo se è possibile che i doppi ricombinanti siano più nomerosi dei singoli ricombinanti della regione 2. Ad ogni modo ecco i miei risultati
A) cromosomi sessuali (non so se è giusto, l'ho dedotto un pò dalla traccia ma non sono per niente convinto)
B) genotipo parentale: sc s v/sc s v (femmina) e +++/sc s v (maschio)
F1 sc s v/+++ (femmina); sc s v/sc s v (maschio)
c)l'ordine è sc s v e la distanza è: tra sc-s di 37,2 um mentre tra s-v di 10 um
d)I=-36 cdc=37
se ho fatto degli errori il tutto dipende dall'acer considerato i doppi ricombinanti quali sc + v; +s+ che nella prole non risultano come i meno numerosi però considerando che i parentali sono sc s v; + + + risultano loro come dco. |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 02 febbraio 2013 : 22:11:02
|
| rettifico cdc=2,05 |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 00:02:56
|
Per l'esercizio 1, a parte il fatto che hai sbagliato a scrivere una classe dei doppi ricombinanti:
Citazione:
A+C 0.96% --- 0,38%
+BC 0.96% --- 0,38%
+B+
e che ci sono delle imprecisioni nelle approssimazioni, il tuo totale non fa 100%, per il resto è giusto.
La seconda parte dell'esercizio è assolutamente uguale, solo che questa volta i geni non sono tutti in cis, ma sono in trans: +b+/a+c , quindi sono diversi i parentali e di conseguenza anche le altre classi. |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 00:13:44
|
Citazione:
Messaggio inserito da hiero
esercizio 2
mi chiedo se è possibile che i doppi ricombinanti siano più nomerosi dei singoli ricombinanti della regione 2.
No! i doppi ricombianti sono sempre i meno numerosi, è SOLO da quello che capisci che sono i doppi ricombinanti.
Citazione:
A) cromosomi sessuali (non so se è giusto, l'ho dedotto un pò dalla traccia ma non sono per niente convinto)
Sì giusto, lo capisci dalla traccia infatti, dato che i maschi hanno fenotipo diverso dalle femmine.
Citazione:
B) genotipo parentale: sc s v/sc s v (femmina) e +++/sc s v (maschio)
F1 sc s v/+++ (femmina); sc s v/sc s v (maschio)
E no, abbiamo detto che i geni sono localizzati sul cromosoma X, i maschi quanti cromosomi X hanno?
Citazione:
c)l'ordine è sc s v
No, l'ordine non è così come ti viene dato dall'esercizio, ma lo capisci dal confronto dei parentali con i doppi ricombinanti, il gene che cambia è quello che sta in mezzo.
Il resto non lo correggo neanche perchè avendo tu cosiderato i doppi ricombinanti sbagliati, i conti sono sicuramente sbagliati!
Riprova segliendo i DCO giusti! |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 01:44:20
|
esercizio2
b) PARENTALI sc s v /sc s v ; +++/Y
F1 sc s v/+++ , sc s v/Y
c) ordine geni sc v s
distanza fra sc-v 33 um ; distanza fra v-s 10 um
cdc= 0,72
I=0,28
va bene ora? |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 02:08:33
|
esercizio 1(ultima parte)
+b+ --> 37%
a+c --> 37%
++c --> 5%
ab+ --> 5%
+bc --> 7%
a++ --> 7%
+++ --> 1%
abc --> 1%
per cdc= 1 (praticamente è tutto uguale al primo caso tranne le classi fenotipiche, giusto?) |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 12:26:23
|
Citazione:
Messaggio inserito da hiero
esercizio2
b) PARENTALI sc s v /sc s v ; +++/Y
F1 sc s v/+++ , sc s v/Y
c) ordine geni sc v s
distanza fra sc-v 33 um ; distanza fra v-s 10 um
cdc= 0,72
I=0,28
va bene ora?
Sì  , a parte che io avrei approssimato a 0,73 e 0,27. |
|
|
|
GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 12:28:16
|
Citazione:
Messaggio inserito da hiero
esercizio 1(ultima parte)
+b+ --> 37%
a+c --> 37%
++c --> 5%
ab+ --> 5%
+bc --> 7%
a++ --> 7%
+++ --> 1%
abc --> 1%
per cdc= 1 (praticamente è tutto uguale al primo caso tranne le classi fenotipiche, giusto?)
Sì è giusto! Esatto i conti sono gli stessi ma cambiando la disposizione degli alleli cambiano le classi fenotipiche. |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 21:18:27
|
dubbio!
in esercizi in cui ho una prole in cui i geni sono in trans ho difficoltà nel distinguere scoI e scoII. Praticamente facendo gli schemini e analizzando la posizione dei singoli crossing over ottengo il fenotipo dei con doppi ricombinanti
ESEMPIO:
+ v lg 305 P
b + + 275 P
b + lg 128
+ v v 112
+ + lg 74
b v + 66
+ + + 22 DCO
b v lg 18 DCO
considerando il crossing over nella prima regione
+---v----lg
b---+----+
ottengo +++; b v lg che in realtà sono DCO
come faccio a sapere con certezza quali sono i scoI e scoII ? |
|
|
|
JGuardaGliUfo
Utente
Città: Roma
641 Messaggi |
Inserito il - 03 febbraio 2013 : 23:49:47
|
Citazione:
in esercizi in cui ho una prole in cui i geni sono in trans ho difficoltà nel distinguere scoI e scoII
Di solito negli esercizi con incroci a 3 punti non si può parlare propriamente di geni in cis o trans, proprio perchè sono 3. Inoltre, prima di determinare singoli crossing over (in I o II "regione"), bisogna ordinare i geni. E credo tu non l'abbia fatto. |
I could not love except where Death
Was mingling his with Beauty’s breath —
Or Hymen, Time, and Destiny
Were stalking between her and me.
E. A. Poe |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 04 febbraio 2013 : 17:00:15
|
continuo a non trovarmi... mi potreste spiegare il metodo?
|
|
|
|
JGuardaGliUfo
Utente
Città: Roma
641 Messaggi |
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 05 febbraio 2013 : 00:47:02
|
l'ordine è v---b---lg
ora come faccio a riconoscere scoI e scoII ? |
|
|
|
JGuardaGliUfo
Utente
Città: Roma
641 Messaggi |
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 07 febbraio 2013 : 20:34:15
|
non so, continuo a non trovarmi....
prendiamo come esempio questo.
+++ 48
++c 437....P
+b+ 4......DCO
y++ 12
yb+ 439....P
y+c 2......DCO
+bc 12
ybc 46
ora, dal confronto tra i parentali e i dco vedo che la posizione dei geni prevede y al centro.
ma non riesco ancora a capire come ricavarmi gli scoI e scoII.L'ordine è by---y----c opuure c----y----by, so che potrei trovarmelo ma non ho scoI ed scoII.Aiutatemi a capire con questi dati, perchè sono molto confuso |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 07 febbraio 2013 : 21:16:28
|
| quello che voglio dire se c'è un calcolo numerico che mi può aiutare subito ad individuare i 2 scoI o viceversa i due scoII |
|
|
|
JGuardaGliUfo
Utente
Città: Roma
641 Messaggi |
Inserito il - 07 febbraio 2013 : 21:58:03
|
| No, non esiste una formula che ti dica quale crossing over avvenga in regione I o II. Per conoscere l'ordine dei geni basta ragionare sui parentali e sui doppi ricombinanti che, avendo le frequenze, riconosci all'istante: i singoli crossing over non ti dicono molto su qual è il gene centrale e, ripeto, per ordinare i geni NON sono fondamentali, anzi. Lascia perdere questi scoI e scoII: sulla base di quei dati dell'esercizio, l'ultimo postato, qual è l'ordine dei geni? Tieni conto solo di parentali e doppi ricombinanti. |
I could not love except where Death
Was mingling his with Beauty’s breath —
Or Hymen, Time, and Destiny
Were stalking between her and me.
E. A. Poe |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 07 febbraio 2013 : 22:09:38
|
l'ordine è b----y-----c ora per trovarmi la distanza fra i geni ho bisogno di quei dati.
il mio libro indica questi ma seguendo il procedimento letto nei link che mi avete consigliato non mi trovo minimamente!
scoI +++,ybc
scoII y++,+bc
|
|
|
|
JGuardaGliUfo
Utente
Città: Roma
641 Messaggi |
Inserito il - 08 febbraio 2013 : 10:13:59
|
Secondo il tuo libro i singoli ricombinanti sarebbero questi:
Citazione:
scoI +++,ybc
scoII y++,+bc
Il gene centrale è y, come hai detto. Quindi l'ordine dei geni è b-y-c. Ma anche c-y-b è corretto. L'importante è che y sia al centro. Con i dati che hai non puoi stabilire con certezza matematica se ci sia c alla destra di y o se ci sia b. Perciò, se consideri b-y-c, allora i parentali sono b+ y c+ e b y+ c. I singoli crossing over invece: I b+ y+ c e b y c+, II b+ y c e b y+ c+. Se l'ordine fosse c-y-b avresti il contrario. |
I could not love except where Death
Was mingling his with Beauty’s breath —
Or Hymen, Time, and Destiny
Were stalking between her and me.
E. A. Poe |
|
|
|
hiero
Nuovo Arrivato
28 Messaggi |
Inserito il - 08 febbraio 2013 : 17:24:09
|
considerando i dati:
+++ 48
++c 437....P
+b+ 4......DCO
y++ 12
yb+ 439....P
y+c 2......DCO
+bc 12
ybc 46
tu mi dici che I singoli crossing over invece: I b+ y+ c e b y c+, II b+ y c e b y+ c+.
Ma secondo i dati sono i parientali
 |
|
|
|
Discussione |
|
mappa genetica
