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Citt�: trieste

10 Messaggi

Inserito il - 13 agosto 2013 : 10:14:09

Vorrei trovare un programma che mi dicesse, una volta inseriti i miei primer, tutti i possibili prodotti che si ottengono in seguito ad una PCR e con che probabilit� li ottengo (partendo da cDNA umano). In questo modo posso sapere quali possibili bande ottengo oltre alla mia proteina di interesse. Grazie

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 21 agosto 2013 : 18:44:42

Questo dovrebbe fare al caso tuo...
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

elenute
Nuovo Arrivato

Citt�: trieste

10 Messaggi

Inserito il - 21 agosto 2013 : 19:08:04

Ho usato proprio quel programma per disegnare i primer..volevo sapere se esiste qualche altro programma che mi desse anche la probabilit� o la percentuale di trascrizione di altri frammenti in modo da sapere se la banda che vedo � la mia oppure � un altro frammento che ha un'alta probabilit� di trascrizione con quei primer. Grazie comunque

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 22 agosto 2013 : 13:47:24

Se i tuoi primer annilassero in un altro punto con una percentuale abbastanza alta, primer blast te lo direbbe. Ovviamente rispettando le temperature di annealing indicate.
Ciao!

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

stefanken
Nuovo Arrivato

39 Messaggi

Inserito il - 29 agosto 2013 : 15:17:57

Ciao,
io posso segnalarti anche in-silico PCR dell'UCSC.
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr?command=start
Lo trovo piuttosto comodo.
Saluti
Stefano