chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 13 ottobre 2013 : 11:54:48
|
C'è un enorme quantità di letteratura (che conosco solo molto superficialmente) a riguardo.
L'idea è che si normalizza per evitare di considerare differenze dovute all'efficienza di ibridazione, a come è stato fatto il chip etc. come reali differenze di espressione.
Questa review spiega bene il concetto (se hai problemi ad accedere al testo integrale mandami pure un MP) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12454644
In particolare dicono:
Citazione: Typically, the first transformation applied to expression data, referred to as normalization, adjusts the individual hybridization intensities to balance them appropriately so that meaningful biological comparisons can be made. There are a number of reasons why data must be normalized, including unequal quantities of starting RNA, differences in labeling or detection efficiencies between the fluorescent dyes used, and systematic biases in the measured expression levels. Conceptually, normalization is similar to adjusting expression levels measured by northern analysis or quantitative reverse transcription PCR (RT-PCR) relative to the expression of one or more reference genes whose levels are assumed to be constant between samples.
|
Sei un nuovo arrivato? Leggi il regolamento del forum e presentati qui
My photo portfolio (now on G+!) |
|
|