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Discussione

CIA
Utente Junior

Prov.: Padova
Citt�: Rivadolmo

233 Messaggi

Inserito il - 16 maggio 2007 : 12:43:21

Ciao a tutti!
Scusate, ma ho seri problemi con questa benedetta bioinformatica

Qui vi elenco alcune domande... non � che per caso qualcuno pu� aiutarmi?

- Come si fa a fare una query in PubMed?

- Come si imagazzina una malattia genetica in PERL?

- 6 comandi Unix

- Come si fa a fare una queruy in GenBank e Genome Browser?

- Perch� si studiano le proteine omologhe e simili?

- descrivere questa interfaccia:

Grazie mille!

CIA
Se � verde o si muove, � biologia. Se puzza, � chimica. Se non funziona, � fisica.

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 16 maggio 2007 : 13:45:36

Ciao CIA!

Non e' complicato ma e' un po' laborioso rispondere a tutte queste domande!

Perche' non provi a scrivere come risponderesti tu, e poi ti diamo una mano a correggere?

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

Fil23
Utente Junior

Prov.: estero
Citt�: London

238 Messaggi

Inserito il - 17 maggio 2007 : 16:58:04

Ciao,
non ho molto tempo....scusa...sicch� rispondo a quelle pi� veloci:
6 comandi unix:
1) pwd --> per sapere in quale directory sei
2) ls --> elenca il contenuto della directory in cui sei
3) cp -r file1 ../giacomo/file2 --> copia il file 1 nella directory giacomo e rinominalo file2
4) rm -r ciao.txt --> rimuovi il file ciao.txt
5) mkdir ciao --> crea la directory "ciao"
6) mv file1 file2 --> rinomina il file1 in file2

perch� si studiano proteine simili e omologhe: si studiano xk� proteine omologhe con alt� % di similarit� hanno generalmente struttura/architettura simile. Quindi se hai 1 proteina con struttura risolta sperimentalmente e hai 1 proteina omologa fortemente simile, ma con struttura non nota, la puoi ricavare per omologia (http://www.molecularlab.it/protocolli/protocol.asp?id=32)

ciao ciao