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kapyn
Nuovo Arrivato
Prov.: napoli
22 Messaggi |
 Inserito il - 17 gennaio 2009 : 15:37:21
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Salve, ho qlche dubbio(sicuramente stupido) sull'identificazione della 3'utr, spero possiate essermi utili.
Devo identificare tale regione nell'mrna delle PAH ( NM_000277 )
Dalle features:
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..2680
gene 1..2680
CDS 473..1831
polyA_site 2680
Da quanto ho capito, la 5'utr va da 1 a 472.
Ora la 3'utr va da 1832 a 2680???oppure bisogna escludere il sito di polia?
Ma poi, come mai non viene riportato il segnale di polA?
In generale, quando devo localizzare una 3'UTR, in caso sia presente anche il segnale di poliadenilazione o come in questo caso solo il sito di poliA, questi si escludono o sono compresi nella 3'utr?
Grazie mille!
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Rosy85
Utente Junior
234 Messaggi |
Inserito il - 18 gennaio 2009 : 11:28:19
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| hmm..forse non ho capito bene..il sito di poliA io lo vedo nella posizione 2680, dove l'mRNA finisce..quindi la 3'UTR secondo me va dal nucleotide 1832 a quello 2680... |
Nasce, cresce e poi finisce. Per quanto triste č la legge universale.
Ciō che č stato nn tornerā. Il massimo che puoi fare č sperare che quello che sarā, sia meglio.
Nessun rimorso nč rimpianto, č inutile.
Carpe diem: panta rei |
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Rosy85
Utente Junior
234 Messaggi |
Inserito il - 18 gennaio 2009 : 11:33:23
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| sono andata a vedere direttamente l'mRNA in questione con l'AN che hai indicato. Se guardi tra le features ad un certo punto c'č un esone che finisce proprio nella posizione 2680 (che casualmente č una A) |
Nasce, cresce e poi finisce. Per quanto triste č la legge universale.
Ciō che č stato nn tornerā. Il massimo che puoi fare č sperare che quello che sarā, sia meglio.
Nessun rimorso nč rimpianto, č inutile.
Carpe diem: panta rei |
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