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Sandrus86
Nuovo Arrivato
30 Messaggi |
 Inserito il - 21 luglio 2009 : 23:01:08
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Qualcuno conosce un buon programma per la lettura di elettroferogrammi con formato ab1?
e possibilmente che permettano un allineamento di una sequenza in tempo reale in modo da poter leggere la sequenza di riferimento e sotto la chiamata di basi della mia sequenza? sto impazzendo e devo ammettere che sarebbe comodo poter allineare e leggere contemporaneamente se c'č o meno corrispondenza, specie per valutare alcuni picchi magari ambigui.
grazie
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AleXo
Moderatore
Prov.: Estero
Cittā: San Francisco, California
1550 Messaggi |
Inserito il - 21 luglio 2009 : 23:20:38
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hai provato 4peaks? e' gratuito! http://mekentosj.com/science/4peaks/
Non so se puoi allineare un elettroferogramma con una sequenza di riferimento in formato testo, per quello forse hai bisogno di programmi + elaborati tipo DNAman.
Forse mi perdo un pezzo, ma non puoi controllare gli elettroferogrammi, esportarli in txt eppoi allineare? |
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Sandrus86
Nuovo Arrivato
30 Messaggi |
Inserito il - 22 luglio 2009 : 13:48:06
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Citazione:
Messaggio inserito da AleXo
hai provato 4peaks? e' gratuito! http://mekentosj.com/science/4peaks/
Non so se puoi allineare un elettroferogramma con una sequenza di riferimento in formato testo, per quello forse hai bisogno di programmi + elaborati tipo DNAman.
Forse mi perdo un pezzo, ma non puoi controllare gli elettroferogrammi, esportarli in txt eppoi allineare?
dunque ho provato 4peaks ma non mi ispira molto.... per quanto i picchi abbiano bella definizione, non poter giocare sulla scala in verticale č un po' scomodo. inoltre manca l'allineamento. so di poterlo fare con programmi come clustal x eccetera, ma quando leggi una sequenza č utile poterti riferire direttamente a quella di riferimento senza stare a esportare, aprire clustalx eccetera....
avete altri consigli?
grazie mille comunque |
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