Devo fare la traduzione di una sequenza proteica con alfabeto esteso(quindi con lettere X, o R per capirci) è giusto tradurlo,in tutto i possibili frame?? Cioè tradurre la X, per tutte le 4 basi azotate???Vi prego chiaritemi questo quesito
Mmm...non ho capito la domanda. Una seq proteica convertita in una sequenza di DNA ha un unico frame...può essere solo quello. Viceversa puoi avere più frame. Riguardo l'alfabeto esteso...non so cosa voglia dire (mi spiace) ma l'amminoacido R esiste, ed è l'arginina. X suppongo voglia dire un aa qualsiasi e credo vada tradotto come nnn (basi generiche, ma non può essere un codone di stop), ma di questo non ne sono sicuro
Ciao, controlla la stringa se corrisponde ai 20 aa, a meno della X... che cmq sarebbe un'impresa ardua....fare tt le combinazioni...quanto è lunga? cmq provo a cercare qualcosa...mi pare di ricordare una sequenza con RX scritte dal mio prof da qualche parte.... buon lavoro