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manjula
Nuovo Arrivato


Prov.: Napoli
Città: napoli


1 Messaggi

Inserito il - 29 settembre 2009 : 18:07:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di manjula Invia a manjula un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Devo fare la traduzione di una sequenza proteica con alfabeto esteso(quindi con lettere X, o R per capirci) è giusto tradurlo,in tutto i possibili frame??
Cioè tradurre la X, per tutte le 4 basi azotate???Vi prego chiaritemi questo quesito

Emanuela Napoletano

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1724 Messaggi

Inserito il - 30 settembre 2009 : 00:21:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Mmm...non ho capito la domanda.
Una seq proteica convertita in una sequenza di DNA ha un unico frame...può essere solo quello. Viceversa puoi avere più frame.
Riguardo l'alfabeto esteso...non so cosa voglia dire (mi spiace) ma l'amminoacido R esiste, ed è l'arginina. X suppongo voglia dire un aa qualsiasi e credo vada tradotto come nnn (basi generiche, ma non può essere un codone di stop), ma di questo non ne sono sicuro

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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miRNA_dangerous
Nuovo Arrivato



18 Messaggi

Inserito il - 30 settembre 2009 : 11:56:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di miRNA_dangerous Invia a miRNA_dangerous un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao, controlla la stringa se corrisponde ai 20 aa, a meno della X...
che cmq sarebbe un'impresa ardua....fare tt le combinazioni...quanto è lunga?
cmq provo a cercare qualcosa...mi pare di ricordare una sequenza con RX scritte dal mio prof da qualche parte....
buon lavoro
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