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morgana83
Nuovo Arrivato

44 Messaggi

Inserito il - 09 luglio 2010 : 17:42:44

Ciao a tutti! ho un problema con questo esercizio di bioinformatica, che prevede la conoscenza di map viewer:
trovare le posizioni del gene umanoF9 e riportare la localizzazione sulla mappa genomica di due STS del gene.

Le posizioni del gene sono:
START: 138612895
STOP: 138645617

Riporto alcune STS:

138612094 138612319
138612187 138612711
138612194 138612549
138612850 138613275
138618203 138618500
138618204 138618566
138618227 138618556
138619208 138619545

io ho scritto che dalla quarta in gi� sono tutte comprese nel gene, ma non capisco come si fa a sceglierle...� una domanda stupida, ma se qualcuno di buona volot� riuscisse ad illuminarmi mi farebbe un grosso favore!!

grazie mille in anticipo

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 12 luglio 2010 : 10:01:13

Credo che il prof ti stia semplicemente chiedendo di sceglierne due a caso, visto che la lista di STS � molto lunga e non � necessario riportare la lista completa.

Stai attenta perch� nella lista di STS che hai postato, mi sembra che una o due si trovano fuori dal gene... ti conviene scegliere due STS che siano totalmente incluse nelle coordinate di inizio e fine del gene.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

morgana83
Nuovo Arrivato

44 Messaggi

Inserito il - 12 luglio 2010 : 11:02:00

Grazie per la risposta! per non sbagliare a scegliere (la prof chiede di scriverne due comprese nel gene), posso riportare quelle che vedo su map viewer, lasciando lo zoom al minimo in modo da avere un campo pi� ristretto e visualizzare meno marcatori? cio�: quelle che visualizzo se non aumento lo zoom saranno sicuramente incluse nelle coordinate del gene...?