domanda semplice...

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Protein sequence analysis in the post-genomic era
Rita Casadio, Lanfranco Masotti

Biochimica sistematica umana. Con CD-ROM
Autori Vari

Storia del pensiero biologico. Diversità, evoluzione, eredità
Ernst Mayr

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Bioinformatica

domanda semplice...

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

alessandravb
Nuovo Arrivato

Prov.: mi

23 Messaggi

Inserito il - 09 agosto 2010 : 17:53:13

Ho appena iniziato a studiare bioinfo e avrei bisogno di un aiuto

...una delle domande è qsta: una volta che cerco il gene SHH nel browser genomico, mi viene chiesto di trovare la differenza tra i diversi "ucsc genes" visualizzati e ql'è il significato deil "blocchi" di diversa altezza.

metto il link della schermata:
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?position=chr7:155595558-155604967&hgsid=167246510&knownGene=dense

valei
Nuovo Arrivato

11 Messaggi

Inserito il - 11 agosto 2010 : 12:35:43

Ciao,
la parte inferiore della schermata bianca e' una rappresentazione grafica di un allineamento multiplo. Ovvero, il tuo gene umano viene allineato e geni apparteneti alla stessa famiglia (verosimilmente si tratta di allinementi dello stesso gene in specie diverse). I vari geni vengono allineati a partire da quello piu' "simile" via via a quello meno. Quando si incontra un "blocco alto" significa che quella zona di gene e' maggiormente conservata nelle diverse specie (se clicci sulla figura ti sara' molto piu' chiaro).
Ciao

alessandravb
Nuovo Arrivato

Prov.: mi

23 Messaggi

Inserito il - 11 agosto 2010 : 13:26:47

in realtà dovrei vedere le differenze clikkando su ucsc gene non nella parte inferiore della schermata e per "blocchi" intende gli esoni presenti nel gene SHH e che significato hanno quelli di diversa altezza...non so se sono stata chiara