Sequenza nucleotidica

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Storia del pensiero biologico. Diversità, evoluzione, eredità
Ernst Mayr

Genetica del comportamento
Autori Vari

Virologia
Renato Dulbecco, Harold S. Ginsberg

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Bioinformatica

Sequenza nucleotidica

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

Remcast
Nuovo Arrivato

3 Messaggi

Inserito il - 15 dicembre 2017 : 12:11:42

Ciao a tutti ragazzi, non riesco proprio a capire come convertire la mia sequenza FASTA in sequenza nucleotidica. So che devo usare tblastn ma poi da lì? Qualcuno potrebbe spiegarmelo passo passo?
La mia sequenza FASTA è la seguente:
>2RTD:B|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
DPSKDSKAQVSAAEAGITGTWYNQLGSTFIVTAGADGALTGTYESAVGNAESRYVLTGRYDSAPATDGSGTALGWTVAWK
NNYRNAHSATTWSGQYVGGAEARINTQWLLTSGTTEANAWKSTLVGHDTFTKVKP
>2RTD:D|PDBID|CHAIN|SEQUENCE
DPSKDSKAQVSAAEAGITGTWYNQLGSTFIVTAGADGALTGTYESAVGNAESRYVLTGRYDSAPATDGSGTALGWTVAWK
NNYRNAHSATTWSGQYVGGAEARINTQWLLTSGTTEANAWKSTLVGHDTFTKVKP

domi84
Moderatore

Città: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 16 dicembre 2017 : 00:11:51

tblastn converte la sequenza in dna E la cerca in un database. Se vuoi solo convertire puoi usare:
https://www.ebi.ac.uk/Tools/st/

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...