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Giulia.Tam
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
 Inserito il - 11 aprile 2013 : 23:56:14
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Salve a tutti,
Sono una studentessa e sto svolgendo una tesi magistrale nell'ambito del drug design.
In particolare al momento sto usando Autodock Vina per fare screening di possibili ligandi della nostra molecola di interesse.
La mia domanda è: qual è la risoluzione dello score di Vina?
In giro avevo sentito che è intorno ai 2-2.5 Kcal/mol. Ma a me sembra un passo molto alto... E comunque non ho trovato fonti certe. Eppure mi sembra un parametro importante da tenere in considerazione in questo tipo di studi!
Un'altra domanda, qualcuno ha mai provato a rifare il training della scoring function di vina per adattare i pesi dei singoli parametri meglio ai propri dati? Se sì, quanti dati sicuri su cui fare il training avevate in mano più o meno?
Ultimissima domanda :). Conoscete altri programmi per fare docking proteina-ligando gratuiti, oltre Autodock, Vina e Dock?
Ciao 
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