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Autore

Discussione

BIOGIOVY
Nuovo Arrivato

Prov.: Napoli
Città: NAPOLI

2 Messaggi

Inserito il - 21 gennaio 2008 : 01:16:53

Qualcuno è pratico di banche dati?
L'esercizio è:
data la sequenza nucleotidica con accession number NM_018032 cercare nella NCBI la lunghezza del tratto codificante, della 3 UTR e della 5 UTR.
Vi prego aiutatemi ho un'esame tra qualche giorno!!!!!
Help Me

chick80
Moderatore

Città: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 21 gennaio 2008 : 01:39:59

Ciao!

E' molto semplice:

1) Vai su NCBI
2) Nel box Search scegli il database Nucleotide e scrivi l'accession number
3) Ti troverà 1 risultato:
Homo sapiens LUC7-like (S. cerevisiae) (LUC7L), transcript variant 1, mRNA
gi|41393557|ref|NM_018032.3|[41393557]
4) Visualizzi la sequenza (a questo punto dovresti essere su questa pagina) e puoi trovare un sacco di informazioni sul gene (cosa fa, links ad articoli etc)
Per trovare la lunghezza della CDS vai verso metà pagina, nella sezione FEATURES e trovi:


  gene            1..2082
  CDS             112..1089

Il che vuol dire che la sequenza riportata (dal nt 1 al 2082) è tutto il gene e la coding sequence è tra la posizione 112 e la 1089.

Sempre nella stessa sezione trovi anche le posizioni dei vari esoni

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