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5y5t3m
Nuovo Arrivato

16 Messaggi

Inserito il - 07 febbraio 2015 : 18:04:39

Ciao a tutti,
devo fare un esercizio di subclonaggio sul PC.
Il gene che devo utilizzare ha id 944830(glucosio deidrogenasi di E. Coli).
Su questo sito http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ho cercato il precedente nella sezione GENE e l'ho visualizzato nel formato FASTA.
Vengo al punto.
Se volessi visualizzare solamente la parte di gene che codifica per il dominio periplasmatico della proteina (posizione 142-796 nella sequenza aminoacidica) come potrei visualizzarlo senza fare calcoli?

Vi ringrazio

5y5t3m
Nuovo Arrivato

16 Messaggi

Inserito il - 08 febbraio 2015 : 20:58:15

Ho risolto parzialmente il problema.
In questa pagina http://www.uniprot.org/uniprot/P15877 ho trovato per quale dominio proteico codificano le varie regioni del gene.
Cliccando su topological domain ottengo la sequenza aminoacidica derivata dalla traduzione.
È possibile visualizzare la relativa sequenza nucleotidica con le relative "coordinate"?

Grazie