allineamento primers-genoma

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Harper. Biochimica
Autori Vari

Biologia vegetale
Autori Vari

Biochimica. Con aspetti molecolari della biologia cellulare
Reginald Garrett, Charles Grisham

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Bioinformatica

allineamento primers-genoma

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

markino3
Nuovo Arrivato

26 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2010 : 13:57:25

Ciao a tutti!
Avrei bisogno di un piccolo aiuto: ho disegnato dei primers per il 16S di un Lattobacillus casei e vorrei allinearli con l'intero genoma per vedere se vi sono altri match che potrebbero portare all'amplificazione di regioni indesiderate. Come posso fare? se utilizzo il programma Blast non mi permette di allineare sequenze cos� corte come quelle dei primers con l'intero genoma, potete aiutarmi?
Grazie mille
Marco

chick80
Moderatore

Citt�: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2010 : 14:02:27

Si pu� settare Blast con opportuni parametri (c'� spiegato nell'help)

Oppure puoi usare Primer Blast che � fatto apposta!
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)