Sto analizzando una sequenza genomica di DNA vegetale divisa in contigs e devo evidenziare microsatelliti per poi disegnare primers per analisi di frammenti. Ora mi capita di trovare alcune "N" sia nella sequenza che all'interno del microsatellite (Esempio nel microsatellite: ACACACACACACANNACACACACAC...). Come comportarmi? Posso usare quei microsatelliti per disegnare primers? o le "N" rendono impossibile usarli? E le "N" nelle regioni fiancheggianti influenzano l'eventuale disegno di primers?