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Autore

Discussione

sergiolino
Nuovo Arrivato

Prov.: Napoli
Città: ercolano

1 Messaggi

Inserito il - 02 maggio 2007 : 16:27:21

Ciao a tutti.
Sono uno studente di ctf e volevo innanzitutto complimentarmi con voi per il forum.
Poi passo a porvi il mio problema:
ho bisogno di scaricare una sequenza da Swiss-prot ed aprirla col modulo Homology di InsightII. Provo a scaricare il file di testo in formato FASTA ma il file pur essendo nella mia directory, in Homology questo file .fas non esiste! Qual'è il problema? Homolgy legge i file .fas? Se no come devo fare?
Grazie a tutti....al prossimo quesito!

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 02 maggio 2007 : 19:06:07

Forse vuole solo un file con estensione '.fasta'.

Non hai qualche tutorial o doc a disposizione?

Altrimenti prova a verificare che il file sia scritto correttamente:

>seq_name commenti
cgatgcatgctacgagct(sequenza)

tra il simbolo '>' e il nome della seq non ci devono essere spazi.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)