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homology modelling loop refinement

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Autore

Discussione

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 08 dicembre 2013 : 11:14:41

Ciao a tutti,
mi trovo alle prese con una struttura pdb in cui mancano un paio di grossi loop (di circa 20 residui). Purtroppo per qui loop non ho trovato template strutturali su cui poterci fare realisticamente homology modelling/threading. Sono peraltro regioni disordinate e distanti dalla parte della proteina che mi interesserebbe investigare.

Siccome per poter procedere nelle mie analisi ho bisogno di una struttura continua, pensavo di ignorare quei loop e completare la strutture con brevi linker.

Farlo � semplice, ma vorrei qualche riferimento bibliografico di supporto se ne conoscete.

Grazie

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada