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supererry
Nuovo Arrivato

Prov.: Torino
Citt�: Torino

82 Messaggi

Inserito il - 26 novembre 2011 : 14:38:07

Ciao a tutti, sto facendo una quantificazione dell'intensit� per cellula di una proteina marcata tramite immunoistochimica (DAB).
tramite imageJ, clicco su ogni cellula e ricevo l'intensit� della proteina in quella cellula.

Mi chiedo una cosa: quando faccio la stessa cosa ma con marcatura fluorescente, calcolo il fondo (tutto ci� che non � nelle cellule) e poi lo sottraggo all'intensit� di ogni cellula misurata. Ma con marcatura tramite DAB, come faccio a eliminare il fondo dalla mia analisi dato che � misurato tramite scala logaritmica dal programma? (per imageJ il bianco viene misurato 100, il nero 1, per esempio).
Devo aggiungerlo all'intensit� delle cellule?

spero di essere stato chiaro...

Grazie a tutti

supererry
Nuovo Arrivato

Prov.: Torino
Citt�: Torino

82 Messaggi

Inserito il - 26 novembre 2011 : 15:11:42

dunque, la domanda �: dato che con la fluorescenza sottraggo il fondo per la misura delle intensit�, con la DAB aggiungo il fondo alle misure di intensit�?

Nero con fluo: 100; bianco con fluo:1
Nero con DAB: 1; bianco con DAB:100