Papillon: pacchetto python per plot RNA-seq

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Scienze. Per le Scuole (5 vol.)
Ezia Nicoletti, Paola Peretti, Gabriella Somaschi

Brock. Biologia dei microorganismi. 1.Microbiologia generale
Michael T. Madigan, John M. Martinko, Jack Parker

Biochimica. Con aspetti molecolari della biologia cellulare
Reginald Garrett, Charles Grisham

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Bioinformatica

Papillon: pacchetto python per plot RNA-seq

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

RNA-seq Galaxy python

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2017 : 00:29:01

Ciao a tutti.
Se avete fatto una RNA-seq con Galaxy/cuffdiff normalmente potete esplorare i geni usando cummeRbund.
Non conoscendo R ho preferito scrivere un modulo in python: Papillon.
Sul sito https://github.com/domenico-somma/Papillon e' presente il manuale e un tutorial. Siccome e' su pypi si installa facilmente con un

pip install papillon

Se a qualcuno andasse di provarlo, qualsiasi feedback qui o sul sito github e' ben accetto.

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...