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Tag   integrase    virus HIV    BLAST  Aggiungi Tag

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Erica_93
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Inserito il - 05 gennaio 2017 : 19:47:46  Mostra Profilo Invia a Erica_93 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti! Scrivo in piena disperazione pre- esame di bioinformatica. Il prof ci ha dato una relazione da svolgere seguendo una traccia. Mi è stata assegnata una proteina codificata dal virus dell'HIV-1. Quando sono andata a fare BLAST con la proteina mi ha trovato tantissime sequenze tutte nominate allo stesso modo della mia e cioè: integrase[Human immunodefiency virus 1]. Aprendole alcune sono identiche anche nella sequenza altre differiscono. Il punto è che non riesco a capire perchè nonostante sono tutte nominate in maniera identica e molte sono identiche anche nella sequenza, sono registrate nel database tutte sotto codici ncbi diversi.
Non so nemmeno se mi sono spiegata bene ma sono disperata, anche perchè poi ho dovuto farci l'albero filogenetico con queste sequenze e non vorrei aver sbagliato anche quello! Help please
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