Genscan e programmi predittivi

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Il patrimonio mondiale dell'Unesco. I santuari della natura
Marco Cattaneo, Jasmina Trifoni

Al cuore della vita. Il suicidio cellulare e la morte creatrice
Jean Claude Ameisen

Scienze. Per le Scuole (5 vol.)
Ezia Nicoletti, Paola Peretti, Gabriella Somaschi

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Bioinformatica

Genscan e programmi predittivi

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

Patrizio
Moderatore

Citt�: Barcellona

1914 Messaggi

Inserito il - 10 ottobre 2008 : 23:19:37

Ai bioinformatici e non
volevo chiedervi se conoscete altri programmi oltre genscan che analizzano le sequenze,visto che ho provato con una sequenza nota,e sineramente non ha azzeccato niente se non il numero di esoni,magari con altri programmi riesco ad avere dei risultati piu' attendibili

thanks

frau_frosch
Utente Junior

Citt�: Boston

225 Messaggi

Inserito il - 11 ottobre 2008 : 17:18:39

Mmm..provato con Genome Scan?
http://genes.mit.edu/genomescan.html

Patrizio
Moderatore

Citt�: Barcellona

1914 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2008 : 14:20:09

Frau_frosh,avevo gia' provato con questo...pero' mi cade la pagina e non mi fa la scansione .....
ricordo che ce n era uno con una drosophila come logo..ma non ricordo il nome

Patrizio
Moderatore

Citt�: Barcellona

1914 Messaggi

Inserito il - 13 ottobre 2008 : 20:11:30

Frau_frosh concludo....dicendo che ho ritrovato fruitfly e mi ha dato degli attimi risultati

http://www.fruitfly.org/seq_tools/splice.html

thnks

frau_frosch
Utente Junior

Citt�: Boston

225 Messaggi

Inserito il - 14 ottobre 2008 : 13:56:52

perfetto...allora lo "bookmarko" questo sito ihih

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 14 ottobre 2008 : 18:00:51

Spiegati bene, non si capisce esattamente quello che vuoi fare.
Cosa vuol dire 'analizzare una sequenza'?

Se vuoi fare le cose per bene dovresti leggerti un po' di bibliografia per capire quello che stai facendo, altrimenti ti sar� difficile interpretare i risultati!!
Ti consiglio di partire da una review come questa:
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15193305?ordinalpos=2&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Pubmed.Pubmed_ResultsPanel.Pubmed_DefaultReportPanel.Pubmed_RVDocSum

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

Patrizio
Moderatore

Citt�: Barcellona

1914 Messaggi

Inserito il - 14 ottobre 2008 : 20:34:39

Sinceramente pensavo si capisse

in quanto avevo parlato di genscan...e l unica analisi che sapevo facesse era quella di vedere dove iniziano e finiscono gli esoni ed introni dando uno score piu' o meno alto
cmq in pratica devo inserire una mutazione in un trascritto e volevo vedere se mi cambiava la lunghezza dell esone,o meglio ancora come ho fatto con fruitfly vedere se mi variava lo score dei siti AG/GT di splicing

Discussione

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Vai a:

MolecularLab.it

Android e Mobile



Scarica le app! Ora anche sul tuo smartphone!

Ciao Login - Iscriviti



Visitatori: 375

Novità
Protocolli di laboratorio: reagenti e tecniche usate in laboratorio biomedico e molecolare.