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sallusti10
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27 Messaggi |
 Inserito il - 25 febbraio 2009 : 15:36:48
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Ciao.
scusate se posto questa domanda che puo' sembrare simile a quella postata ptrwecedentemente ma non lo e'.
Con psi blast sono riuscito ad ottenere la mia PSSM, con per ogni aa della mia seq di input uno score. Partendo da questo score come posso calcolare la frequenza relativa di quell'aa? Esiste una formula che mi permette di farlo? In un articolo ho trovato una cosa del genere, del tipo:
1/(1+e*(-x)), dove x e' lo score dell'aa nella PSSM di rifermineto.
Posto anche il titolo del paper :
"Protein Secondary Structure Prediction Based on Position Specific Scoring Matrix", autore David T. Jones.
Grazie per una eventuale risposta
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Calcolare le frequenze relative dai profili
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