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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 11 settembre 2006 : 21:46:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
cin don't worry, lo metto a posto io stasera quando torno dal lab.
Se mi dai il link al protocollo faccio anche prima.

Grazie

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cin
Utente Junior

ptero

Prov.: Padova
Città: Padova


558 Messaggi

Inserito il - 11 settembre 2006 : 23:23:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cin Invia a cin un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Se intendi dire dove ho guardato la metodica, ho semplicemente guardato sul manuale del kit e l'ho tradotto con le varie modifiche apportate dal mio lab o da me. Se vuoi sapere qual'è il protocollo è quello sull'estrazione di RNA da tessuto adiposo etc. Non penso che tu voglia quest'ultimo link, e anche se fosse con questo cavolo di computer di mio marito non riesco a fare nulla, già io sono imbranata di mio, mettici poi che lui usa solo linux e assolutamente si rifiuta di usare windzoz...... non so proprio da che parte girarmi. Comunque grazie per il riordino e buona notte.
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 12 settembre 2006 : 09:04:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ora è a posto!
Quando inserisci i vari passaggi li devi mettere fra [step] e [/step]

Ad es:
[step]Aggiungere 5 ml di etanolo[/step]

La stessa cosa x [tip] e [/tip].


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cin
Utente Junior

ptero

Prov.: Padova
Città: Padova


558 Messaggi

Inserito il - 12 settembre 2006 : 10:23:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cin Invia a cin un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie chik, è bellissimo, hai messo anche i link....
Ho solo un punto da sistemare, perchè avevo messo evidentemente uno step in più: dopo "pipettare 700microl nelle colonnine...", c'è lo step "centrifugare a 10000rpm...", ecco, vanno insieme, perchè lo step successivo dice di ripetere il tutto, ovvero pipettata e centrifugata insieme.
Spero di non averti fatto troppo casino!

Appena avrò un po' di tempo cercherò di mettere qualche protocollo ELISA, ma sempre roba dei kits,non so se ha tanto senso, visto che cambiano a seconda dilla ditta, magari se mi spieghi cosa andrebbe messo in particolare per gli ELISA vedrò di farlo.
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biotech
Utente Junior

Prov.: Padova
Città: Padova


170 Messaggi

Inserito il - 14 settembre 2006 : 20:49:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di biotech  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di biotech Invia a biotech un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Tutti i protocolli che ho? riempirei un po' troppo...

http://boincstats.com/signature/user_1342603.gif
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 14 settembre 2006 : 22:00:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh, non ci sono problemi di spazio, don't worry!

@cin: ora è tutto a posto, ma dimmi una cosa, quando guardi la lista dei protocolli tu vedi due link vicino al tuo protocollo con scritto modifica e cancella?
Non che sia un problema per me metterli a posto, voglio solo sapere se c'è qualche bug nel codice!

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cin
Utente Junior

ptero

Prov.: Padova
Città: Padova


558 Messaggi

Inserito il - 15 settembre 2006 : 14:18:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cin Invia a cin un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No, non li vedo.
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 15 settembre 2006 : 22:42:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Hmmmm... interessante dovresti vedere qualcosa del genere:


Conta che tu dovresti avere i link solo sui tuoi protocolli, io li posso modificare tutti perchè ho dei poteri supernaturali!!!

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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
Città: Milano


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Inserito il - 16 settembre 2006 : 02:10:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ehm..
ho dato una occhiata, ed ho trovato un errorino... :-P
Ora potrai aggiornarlo senza problemi ;-)

Sorry e grazie per il feedback involontario,

Riccardo

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cin
Utente Junior

ptero

Prov.: Padova
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Inserito il - 18 settembre 2006 : 09:33:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cin Invia a cin un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Adesso è tutto OK, grazie ragazzi. Di tutto.

Per Nico: non avevo dubbi sui tuoi poteri, dì la verità sei molto extra e poco terrestre, vero?
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cin
Utente Junior

ptero

Prov.: Padova
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558 Messaggi

Inserito il - 18 settembre 2006 : 12:27:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cin Invia a cin un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In realtà non è poi tutto OK, perchè ho inserito un nuovo protocollo, poi ho cercato di modificarlo, ma mi appare un messaggio: solo l'amministratore, i moderatori e l'autore del protocollo possono modificarlo. Ma non mi chiede nullaltro ( password etc.).
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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
Città: Milano


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Inserito il - 18 settembre 2006 : 12:35:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
mi metto all'opera cin :-)

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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
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Inserito il - 21 settembre 2006 : 11:08:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Riprova ora cin, ho sistemato l'update e l'anteprima dell'update.

Se hai altri problemi... fammi sapere.

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cin
Utente Junior

ptero

Prov.: Padova
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Inserito il - 27 settembre 2006 : 17:07:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di cin Invia a cin un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ora è davvero tutto ok, grazie atreliu.
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GFPina
Moderatore

GFPina

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Inserito il - 28 settembre 2006 : 18:50:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao!
Ho inserito il protocollo per la colorazione con Blue Coomassie, mi sono accorta però inserendo il reagente che è "Coomassie" e non "Comassie" come avevo scritto io, ho corretto il protocollo ma il nome delle soluzioni è sbagliato e quindi non riconosce più il link all'interno del protocollo.
Però non riesco a modificare il nome delle soluzioni già inserite!!!


Che pasticciona che sono!!!

Per il resto spero vada bene il protocollo!
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 28 settembre 2006 : 21:50:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No problem, correggo io

Grazie
nico

PS: causa piccolo bug... quando inserite i reagenti se mettete il peso molecolare NON mettete decimali

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


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Inserito il - 29 settembre 2006 : 20:18:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie mille!

Io ovviamente però ho messo i decimali!!!
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


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Inserito il - 29 settembre 2006 : 23:13:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
eheh, l'ho detto per quello!
Ma non ti preoccupare, mea culpa che ho sbagliato qualcosa nel codice, vedremo di metterlo a posto al più presto!

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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
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Inserito il - 30 settembre 2006 : 09:23:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io per ora ho specificato di non metterli..
anche se a dire la verità non sono riuscito a rifare l'errore:
mettendo 10.52 ad esempio non ho avuto problemi... (ora riprovo con la virgola..)

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GFPina
Moderatore

GFPina

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Inserito il - 30 settembre 2006 : 12:27:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Va bene allora dovrai correggere tu Chick!
Tanto io non posso farlo!!!
A parte gli scherzi:
adesso i pesi molecolari sono sbagliati,
- Blue Coomassie c’è scritto 85g/mol invece di 854g/mol
- Acido Acetico non so come mai ci sono i kDa al posto di g/mol come tutti gli altri reagenti comunque dovrebbe essere 60 g/mol
(Ah… forse è perché ho messo la virgola mentre per il Coomassie ho usato il punto! )

Comunque se servono sono queste:

Acido acetico:
R 10 : Infiammabile
R 35 : Provoca gravi ustioni
S 23 : Non respirarne i gas e i vapori, i fumi, gli aerosol (termini adatti specificati dal produttore).
S 26 : In caso di contatto con gli occhi, lavare immediatamente e abbondantemente con acqua e consultare uno specialista.
S 45 : In caso d'infortunio o di malore, consultare immediatamente un medico (recare possibilmente con sé l'etichetta).

Blue Coomassie:
S 22 : Non respirarne le polveri.
S 24 : Evitare il contatto con la pelle.
S 25 : Evitare il contatto con gli occhi.

Infine adesso Coomassie è scritto tutto con una “O” sola, la dicitura corretta sarebbe con 2… per me è uguale comunque (non vorrei rompere troppo), vedete voi se volete correggerlo o no!
(Nei miei protocolli in laboratorio c’è scritto dappertutto sbagliato!!!)

Comunque prometto:
al prossimo protocollo farò più attenzione!!!

Grazie di tutto!!!
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chick80
Moderatore

DNA

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Inserito il - 30 settembre 2006 : 23:24:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ooops! Mea culpa! Pensavo Coomassie si scrivesse con una sola o... ora è veramente tutto ok (credo)!

Il problema con il peso molecolare è questo: se metti un valore con la virgola o con il punto non li interpreta e quindi 60,05 viene visto come 6005 (e te lo dà come 6.005 kDa).
Ricky, se hai un po' di tempo dacci un occhio

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atreliu
Amministratore

2970fired

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Inserito il - 01 ottobre 2006 : 03:56:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ci penso, ed elaboro una strategia.. devo vedere un po' come immagazzina i dati sul DB ed altre..
poi con un eventuale parsing del valore scritto e qualche altro amenicolo dovrei riuscire a risolvere il problema.
Domani mattina però dovrei anche iniziare a vettorializzare un opera di Keit Haring... da foto tutte storte (un lavoraccio..)

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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
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Inserito il - 01 ottobre 2006 : 12:15:17  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Corretto:
cambiato tipo di storage del dato nel database,
ed un piccolo script per assicurarsi di scrivere bene il numero (Es. 10.23 - ovvero si usa il punto e non la virgola)

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


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Inserito il - 01 ottobre 2006 : 14:23:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
poi con un eventuale parsing del valore scritto e qualche altro amenicolo dovrei riuscire a risolvere il problema.


Va bene mi fido!!!
Grazie comunque ad entrambi per aver risolto il problema e aver sistemato la metodica!
Siete Grandi!!!

P.S.
Citazione:
Mea culpa! Pensavo Coomassie si scrivesse con una sola o...
Ah beh Chick mi consolo, allora non ero sola!!! Io l'ho scoperto quando sono andata a cercare i simboli di rischio per inserire il reagente!!!
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pipola
Nuovo Arrivato

Prov.: Pordenone
Città: Casarsa


14 Messaggi

Inserito il - 31 luglio 2007 : 19:16:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di pipola Invia a pipola un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti!
Sto cercando un'informazione su una tecnica e mi hanno suggerito di rivolgermi a voi...
Dunque, in laboratorio sto applicando una variante alla classica real time PCR ovvero: dopo 10 cicli blocco la reazione, aggiungo ulteriore mix (con una quantità dimezzata di oligo) ad ogni campione e faccio ripartire la real time PCR per altri 40 cicli. Questa tecnica del "rinfresco" mi è stata suggerita da una ragazza che lavora in lab qui con me, si ricordava di averla letta da qualche parte.
Avete per caso usato anche voi questa tecnica, o ne avete sentito parlare?...Pare funzioni, ma vorrei avere il supporto magari di qualche articolo!
Vi ringrazio in anticipo per la collaborazione!
Buon lavoro,
Elisa
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