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dallolio_gm
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Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
 Inserito il - 14 giugno 2010 : 18:53:28
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Sí, la funzione matematica č quella che trovi anche su wikipedia:
F0j = d * j
Fi0 = d * i
fonte: wikipedia-needleman_wunsch
Sembra complicato ma in realtā vuol dire semplicemente che devi calcolare i tre possibili punteggi partendo da una delle tre caselle in diagonale, in alto o in basso, e prendere solo il punteggio massimo.
Se guardi alla pagina per l'allineamento locale, la funzione č scritta in maniera piu' chiara:
http://en.wikipedia.org/wiki/Needleman-Wunsch
anche se per trasformarla in allineamento globale devi cancellare il primo caso, in cui dice '0', e inizializzare F0j Fi0 come sopra. |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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equazione matematica per le matrici globali(needleman)
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