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Zia
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
 Inserito il - 20 giugno 2010 : 15:09:52
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Ciao a tutti!
Sono alle prese con l'ultimo esame pre laurea (quindi sono più esaurita del normale...) e non riesco a fare pace con R... siamo proprio in rotta, sob sob sob.
Il mio problema è questo: ho calcolato 4 matrici di distanza e dovrei mettere i grafici di queste in un'unica finestra: per i sani di mente dovrebbe essere semplice (soprattutto perchè esistono manuali...) ma per me al momento è un cruccio non indifferente!
Spero qualcuno possa aiutarmi... ne va della salute del mio PC che sta per essere scaraventato dal balcone se non "mi obbedisce"! :)
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 20 giugno 2010 : 15:35:16
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Ci sono vari modi, ma il mio preferito è:
par(mfrow = c(2,2))
plot(matrice1, ......)
plot(matrice2, ......)
plot(matrice3, ......)
plot(matrice4, ......)
Cambia il parametro mfrow a seconda di quante righe/colonne vuoi |
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Zia
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 20 giugno 2010 : 18:34:52
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Grazie!!! Perfettamente riuscito il bel graficozzo! :)
Sono passata ora al bootstrap: nessun problema tecnico... se non per la voglia strana del prof/esercizio di vedere il bs come termometro... a livello sintattico, dove lo metto????
Grazie di nuovo, il mio neurone stanco te ne sarà grato! |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 20 giugno 2010 : 19:50:54
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Citazione:
se non per la voglia strana del prof/esercizio di vedere il bs come termometro... a livello sintattico, dove lo metto????
hmmmm.... non ho capito bene la domanda! Puoi spiegarti meglio? |
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Zia
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 20 giugno 2010 : 20:26:36
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Ok, ci provo.
L'esercizio chiede di calcolare i valori di bootstrap per il nj-tree secondo Kimura 1980 e di disegnare l'albero,utilizzando la rappresentazione a termometro per i valori di bootstrap.
Io ho calcolato con:
bs=phylo.boot(....)
plot(..)
..$node.label=bs
nodelabels(..$node.label,cex=0,7)
ma non so come e soprattutto dove inserire l'attributo "thermometer", che mi rappresenta il valore di bootstrap nel grafico come se fosse un termometro.
Spero di essere stata più chiara |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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bourbaki
Nuovo Arrivato
2 Messaggi |
Inserito il - 21 giugno 2010 : 09:28:00
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Citazione:
Messaggio inserito da Zia
Ok, ci provo.
L'esercizio chiede di calcolare i valori di bootstrap per il nj-tree secondo Kimura 1980 e di disegnare l'albero,utilizzando la rappresentazione a termometro per i valori di bootstrap.
Io ho calcolato con:
bs=phylo.boot(....)
plot(..)
..$node.label=bs
nodelabels(..$node.label,cex=0,7)
ma non so come e soprattutto dove inserire l'attributo "thermometer", che mi rappresenta il valore di bootstrap nel grafico come se fosse un termometro.
Spero di essere stata più chiara
facile:
node.labels(thermo=bs/100,col=...)
bourbakis@gmail.com |
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