Uso di ClustalW

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Autore

Discussione

turok
Nuovo Arrivato

Prov.: Siracusa
Citt�: Siracusa

47 Messaggi

Inserito il - 15 novembre 2010 : 19:16:03

Ciao a tutti, c'� qualcuno che saprebbe dirmi come fare ad usare ClustalW.
Io ho 2 sewquenze genomiche copiate da internet in 2 file .txt, come faccio per allinearle con clustalw?
Grazie.

Non � perch� le cose sono difficili che non osiamo, ma � perch� non osiamo che le cose sono difficili.
Seneca.
� pi� facile spezzare un atomo che un pregiudizio.
Albert Einstein.

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2010 : 09:37:17

Apri ClustalW http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/
Scrivi le 2 sequenze dove dice:
"STEP 1 - Enter your input sequences

Enter or paste a set of sequences in any supported format:"
scegli se sono proteine o dna e poi "submit"

C'� anche il manuale:
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/help/index.html

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

Vero_nica
Nuovo Arrivato

1 Messaggi

Inserito il - 12 gennaio 2014 : 11:54:24

Ciao a tutti, a breve devo sostenere l'esame di bioinformatica, nel compito c'� una domanda: dato il file di sequenze.txt(scaricabile all'indirizzo www.unifi.it/dblemm,sezione didattica)allineare le sequenze utilizzando clustalw e valutare la conservazione dell'allineamento con il calcolo dell'entropia...Vi chiedo se gentilmente qualcuno pu� dirmi come faccio ad utilizzare clustalw, quando provo a caricare le sequenze esce sempre la scritta che ci sono due sequenze che non coincidono, cio�

Grazie