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markino3
Nuovo Arrivato

26 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2010 : 13:57:25

Ciao a tutti!
Avrei bisogno di un piccolo aiuto: ho disegnato dei primers per il 16S di un Lattobacillus casei e vorrei allinearli con l'intero genoma per vedere se vi sono altri match che potrebbero portare all'amplificazione di regioni indesiderate. Come posso fare? se utilizzo il programma Blast non mi permette di allineare sequenze cos� corte come quelle dei primers con l'intero genoma, potete aiutarmi?
Grazie mille
Marco

chick80
Moderatore

Citt�: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 23 dicembre 2010 : 14:02:27

Si pu� settare Blast con opportuni parametri (c'� spiegato nell'help)

Oppure puoi usare Primer Blast che � fatto apposta!
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

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