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Ryo Saeba
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 18 marzo 2011 : 11:59:16

Intanto salve a tutti!!!

Ho bisogno di una mano con questo script....

----------------------------------------------------------------

Scrivere uno shell script che, data una proteina in formato pdb,
generi un file contenente per ogni helix o sheet,
l'elenco degli amminoacidi contenuti in ciascuna di essi.

Esempio:

Helix 1: ALA VAL LYS ....
Helix 2: LEU LIS ...
Sheet 1: ARG ASP ASN ...

----------------------------------------------------------------

Qualcuno � cos� magnanimo da darmi una mano e farmi capire i passaggi?
So che � semplice ma sto ristudiando da poco bash.. e non ricordo molto... direi poco... vi ringrazio in anticipo della cortesia...

Allegato:

1NVQ.pdb.txt
229,43 KB

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 18 marzo 2011 : 14:34:34

ciao,
certo che ti possiamo dare una mano: per� se vuoi che l'aiuto sia veramente utile, dovresti postare almeno un esempio di quello che hai provato a fare fino ad adesso. Per esempio, prova a postare qui lo script che hai scritto, o ad indicare quali comandi ti sembrano appropriati per risolvere il problema.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

Ryo Saeba
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 08 aprile 2011 : 10:14:49

Pensavo di averlo messo negli allegati.. sorry..

Comunque non serve pi�.. alla fine ho combinato..

Grazie lo stesso della disponibilit�!