Salve a tutti! avrei bisogno di alcuni consigli per l'allineamento di due sequenze proteiche, perchè non ho ben capito quale sia il miglior programma da utilizzare a tale scopo. Vorrei allineare la sequenza primaria di due proteine (2 aspartyl proteasi) che probabilmente anche se mostrano una certa somiglianza strutturale non presentano un'elevata similarità a livello di sequenza primaria.
In questo caso ha più senso effettuare un allineamento locale piuttosto che uno globale?
Quale programma mi consigliereste a tale scopo?Uno di questi può andar bene?