cosa si intende per stringa consenso?

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Post-human. Verso nuovi modelli di esistenza
Roberto Marchesini

Marie Curie
Susan Quinn

Conservazione della natura
Luciana Carotenuto, Richard B. Primack

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Bioinformatica

cosa si intende per stringa consenso?

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

viggy
Nuovo Arrivato

41 Messaggi

Inserito il - 30 settembre 2011 : 11:09:38

sto preparando l'esame di bioinformatica, e nell'affronatare la ricerca di pattern secondari ho trovato l ' espressione "stringa consenso" riferita al pattern stesso.
potete spiegarmi cosa significa?
grzie a tutti.

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 30 settembre 2011 : 11:21:06

Semplicemente la stringa composta dai nucleotidi pi� comuni in ogni posizione.

Immagina di avere tre sequenze:


AAGACCCTTTT
AAAACCCTTAT
ATAACCCTTTT

La sequenza consenso sar� AAAACCCTTTT, o, a seconda del threshold utilizzato, A[AT][AG]ACCCTT[AT]T.

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

viggy
Nuovo Arrivato

41 Messaggi

Inserito il - 30 settembre 2011 : 12:01:36

grazie mille, finalmente mi � chiaro!