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Gst
Utente Junior
Prov.: Roma
Città: Ariccia
143 Messaggi |
 Inserito il - 04 ottobre 2011 : 21:12:41
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Ciao a tutti ragazzi 
sono una biologa, non una bioinformatica, quindi mi scuserete per la mia ignoranza...
Mi chiedevo se un gene di mio interesse possa essere un oncosoppressore, quindi ho pensato di vedere se magari sue mutazioni sono frequenti in tumori.
Volevo sapere se potevate consigliarmi databases in cui sono presenti mutazioni presenti in campioni tumorali.
Se non sbaglio, genome atlas è uno di questi... anche se non mi sembra di semplice utilizzo e soprattutto mi piacerebbe consultarne più di una.
Grazie 1000 
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Ascoltami con gli occhi... |
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cloudany
Nuovo Arrivato
17 Messaggi |
Inserito il - 08 ottobre 2011 : 16:46:49
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| Cercando con Google posso confermale che ATLAS dovrebbe essere perfette per la sua richiesta, provi a vedere e ci dia conferma ;) |
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BLAST
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 10 ottobre 2011 : 12:18:32
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Potresti provare a scorrere le banche dati presenti nella review annuale presente nella rivista NAAR, questa per esempio potrebbe fare al caso tuo: http://bioinf-data.charite.de/cancerresource/index.php?site=home
Più in generale, se sei interessata ad un gene in particolare potresti fare una ricerca mirata su PubMed per vedere se è stato descritto nell'ambito della patologia di cui ti stai occupando.
Buona ricerca!  |
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Gst
Utente Junior
Prov.: Roma
Città: Ariccia
143 Messaggi |
Inserito il - 27 ottobre 2011 : 16:19:58
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Grazie ad entrmbi ragazzi
Purtroppo al momento Atlas non è disponibile: è in aggiornamento...
Comunque in passato l'avevo consultata ed avevo trovato che il mio gene è mutato in alcuni campioni tumorali. Il problema è che non sapevo dire quanto fossero significativi quei dati: se il mio gene è mutato su 1 campione di 10 analizzati, o in uno di 33 analizzati, posso considerare rilevanti questi dati?
Per quanto riguarda il link che mi hai postato BLAST: grazie 1000! davvero interessante. Ma purtroppo non ho trovato niente che faccia al caso mio.
Volevo sapere qual è la rivista NAAR a cui fai riferimento: non son riuscita a trovarla! Ed in particolare, qual è la review a cui ti riferisci?
Inoltre, qualcuno di voi conosce ONCOMINE? me ne hanno parlato bene, ma SE non ho capito male si può accedere alla banca dati solo a pagamento!!!!
Grazie 1000 per l'aiuto!
Vale |
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