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xgabrix
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Inserito il - 20 novembre 2011 : 12:42:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di xgabrix Invia a xgabrix un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti, sono in preda ad una relazione di fisiologia e vorrei farla il meglio possibile e soprattutto con la massima precisione che ci può essere utilizzando dati sperimentali ottenuti. Quello che voglio chiedere è, come faccio a costruire una curva di calibrazione(e non una retta di taratura perchè il grafico di dispersione che ho già ottenuto non è una retta) che mi prmetta di individuare un certo valore in ascissa conoscendo il valore in ordinata?
mi spiego:
i miei dati in ordinata sono delle diverse % di lisi di eritrociti, ognuna ottenuta ad una precisa soluzione NaCl ad una determinata concentrazione. Mi si chiede di individuare il valore di concentrazione di NaCl alla quale si ha 50% di lisi.(a mano lo so fare...il problema è che nn mi sembra tanto preciso)

Voglio precisare che le % messe in ordinata risultano come la media di tre valori, inoltre il nà di valori usati per costruire la curva sono 9.

ecco magari se non volete rispondere esattamente, magari sapete consigliarmi un link da cui leggere?
grazie

Martin.diagnostica
Utente Attivo

H. pylori



1582 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2011 : 13:32:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Martin.diagnostica Invia a Martin.diagnostica un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ecco se i dati seguissero un andamento lineare si potrebbe utilizzare una retta d'interpolazione. Hai calcolato il coefficiente di Pearson (R)

http://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Pearson_product-moment_correlation_coefficient&oldid=459632135

Citazione:
Mi si chiede di individuare il valore di concentrazione di NaCl alla quale si ha 50% di lisi.


Potrebbe essere un flesso è si potrebbe usare il metodo delle derivate
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xgabrix
Nuovo Arrivato



82 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2011 : 14:05:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di xgabrix Invia a xgabrix un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
non vorrei sbagliare ma in questo modo otterrei una retta, mentre quello che io voglio calibrare una curva che ha andamento molto simile ad una sigmoide
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Martin.diagnostica
Utente Attivo

H. pylori



1582 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2011 : 14:24:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Martin.diagnostica Invia a Martin.diagnostica un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
i dati visto che è solo un esperimento didattico volendo li potresti postare. Il coefficiente R serve a vedere quanto uno scatter di punti è lineare, più si avvicina a 1 e più è alta la % di correlazione.

Se il grafico è una sigmoide (come credo) allora R avrà un valore tipo 0.5 e il valore di [NaCl]->50% è il punto di flesso e si individua col metodo delle derivate
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xgabrix
Nuovo Arrivato



82 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2011 : 15:46:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di xgabrix Invia a xgabrix un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
%lisi media
1,3
1,9
4,0
24,8
96,3
98,9
100,6
97,8
100,0
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xgabrix
Nuovo Arrivato



82 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2011 : 15:49:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di xgabrix Invia a xgabrix un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Concentrazione NaCl % quest'ultima colonna sono i dati delle ascisse... dopo aver calcolato questo coefficiente come posso
usare questa info x costruirmi questo grafico su excel? GRAZIE :)
0,9
0,79
0,7
0,6
0,48
0,39
0,3
0,18
0,09
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Martin.diagnostica
Utente Attivo

H. pylori



1582 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2011 : 18:38:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Martin.diagnostica Invia a Martin.diagnostica un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si vede che è una sigmoide è inutile che calcoli r

se clicchi qui trovi del materiale che sebbene si riferisca alla titolazione andrà benissimo buon lavoro

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xgabrix
Nuovo Arrivato



82 Messaggi

Inserito il - 20 novembre 2011 : 19:00:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di xgabrix Invia a xgabrix un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Molto interessante e utile..grazie, però volevo chiedere se ci sono metodi che permettono di farlo con excel, e se è utile per un grafico considerare l'errore che si ottiene da %lisiMAGGIORE-%lisiMINORE diviso 2.
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Glubus
Utente Junior

pinolo



156 Messaggi

Inserito il - 21 novembre 2011 : 08:37:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Glubus Invia a Glubus un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ma come è che si può avere una lisi superiore al 100%?


Mi spiace ma non so usare excel. Sembra però che la vecchia regressione logistica funzioni bene.
La puoi pensare come una regressione utilizzando al posto delle percentuali i logaritmo degli odds delle tue proporzioni e cioè




2,04 KB

bisogna ricorrere ad un software specializzato per calcolare i parametri di regressione.
Nel tuo caso la curva logistica stimata, riportata sulla scala di percentuali, è questa:



4,64 KB
ed i parametri della equazione di regressione



2,06 KB

sono alfa= 12.38533 e beta= -21.77478, ora tu vuoi sapere il valore atteso di concentrazione di NaCl quando al proporzione di eritrociti che subiscono lisi è del 50% e cioè quando l'odds = [p/(1-p)] = 1 e quindi il log-odds è uguale a 0.
se risolvi l'equazione



2,9 KB

trovi




2,12 KB

Stefano

addendum: questo è il risultato ottenuto utilizzando la media di tre esperimenti. La faccenda si complica sensibilmente se dovessimo considerare i valori individuali dei tre prove separate, con misure quindi non-indipendenti (entro prova).
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xgabrix
Nuovo Arrivato



82 Messaggi

Inserito il - 21 novembre 2011 : 14:41:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di xgabrix Invia a xgabrix un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
molto interessante veramente, ma questa è l'analisi ultima che solitamente viene fatta x un esperimento o è cmq una semplificazione di tipo didattico? secondo, sai dove posso trovare delle guide o cmq il software adatto a ottenere questi risultati molto interessanti? soprattutto perchè mi piacerbbe poter applicare questo anche ad altre analisi di dati...per esempio non sò come trovare alfa e beta..:):)

Grazie!
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Glubus
Utente Junior

pinolo



156 Messaggi

Inserito il - 21 novembre 2011 : 16:43:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Glubus Invia a Glubus un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da xgabrix

molto interessante veramente, ma questa è l'analisi ultima che solitamente viene fatta x un esperimento o è cmq una semplificazione di tipo didattico? secondo, sai dove posso trovare delle guide o cmq il software adatto a ottenere questi risultati molto interessanti? soprattutto perchè mi piacerbbe poter applicare questo anche ad altre analisi di dati...per esempio non sò come trovare alfa e beta..:):)

Grazie!



l'esemplficazione è didattica quanto il tuo esempio, non te lo so dire: se i tuoi dati erano dati veri e non inventati il modello potrebbe avere qualche applicazione pratica. Ad occhio sembra che il modello logistico si adatti ai dati in modo accettabile, quello che manca è la stima dell'incertezza dei parametri di regressione (tu hai fornito dei dati aggregati). Un modello non è mai buono "in se" ma è semmai utile o meno utile per rappresentare la tua realtà sperimentale. La regressione logistica è una scelta ragionevole quando la variabile dipendente è una proporzione, anche se siamo abituati a vederla utilizzata soprattutto negli studi epidemiologici non vedo ragionedi non utilizzarla qui.
Per l'approfondimento dipende molto dal livello da dove parti, google ti fornirà molti spunti, ...
Stefano
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