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Francuzz
Nuovo Arrivato



18 Messaggi
Inserito il - 28 dicembre 2011 : 16:09:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Francuzz Invia a Francuzz un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti. Mi servirebbe qualche piccola dritta.
Mi occupo di genotipizzazione. Ho a che fare con campioni piccoli e vorrei fare delle simulazioni.
Esempio:
Casi: AA 114 AG 29 GG 7
Controlli: AA 93 AG 49 GG 8

Sono appena 150 campioni per gruppo. Come potrei farli diventare 1000? Quali sono i principali parametri statistici da valutare?

Sto cercando di approcciarmi ad SPSS e ad R per il p value, l'odds ratio, e l'equilibrio di Hardy-Weinberg.

Grazie a tutti.

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 28 dicembre 2011 : 16:39:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Hmmmm... il bootstrapping non ti permetterà di ottenere 1000 campioni.
Quello che puoi fare è fare 1000 cicli di bootstrapping in ciascuno dei quali creerai una popolazione di 150 campioni ottenuti facendo un sampling (con rimpiazzamento) dei tuoi dati. Analizzando il comportamento medio delle 1000 popolazioni così ottenute potrai avere un'idea del comportamento della popolazione generale a partire dal tuo sample ridotto.
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Francuzz
Nuovo Arrivato



18 Messaggi
Inserito il - 28 dicembre 2011 : 16:58:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Francuzz Invia a Francuzz un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie per la repentina risposta.
Sei stato chiarissimo. Scusa se ne approfitto.
Avrò 1000 popolazioni da 150 campioni l'una. Come farò ad analizzare il comportamento medio?
Con quale software lo faccio?
Grazie
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 28 dicembre 2011 : 17:12:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
R ha un bellissimo package chiamato boot, che fa tutto quanto :)

Qualche link utile:

R Library: Introduction to bootstrapping

Resampling Methods in R: The boot Package (PDF)

Quick-R: Bootstrapping

Randomization, Bootstrap and Monte Carlo Methods in Biology, Third Edition (ottimo libro, consigliato!)

L'esatta procedura, poi, dipende da cosa vuoi calcolare ovviamente!!!
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Francuzz
Nuovo Arrivato



18 Messaggi
Inserito il - 29 dicembre 2011 : 09:16:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Francuzz Invia a Francuzz un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie!!! Sei stato molto esauriente. Buon lavoro.
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