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w_hite
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22 Messaggi

Inserito il - 22 gennaio 2012 : 18:44:37

Ciao a tutti!
Spero mi possiate dare una mano...Sto cominciando a prendere confidenza con i siti delle varie banche dati,in vista dell'esame di bionformatica. Se ad es. ho a disposizione i codici pdb di queste tre transglutaminasi:
1) 3LY6
2) 2Q3Z
3) 1KV3

e mi si chiedesse di descrivere le maggiori differenze in termini di struttura terziaria analizzando appunto il sito pdb cosa devo andare a cercare?
Noto subito dall'immagine che 2Q3Z ha una conformazione differente dalle altre 2,ma poi non so come muovermi per cercare delle info...

w_hite
Nuovo Arrivato

22 Messaggi

Inserito il - 23 gennaio 2012 : 16:51:43

Ho provato a mettere la sequenza FASTA di queste transglutaminasi in PSIpred e Prediction protein per avere info sulla percentuale di alfa elica,foglietti beta ecc... e coincidono più o meno,ma la domanda è relativa alle DIFFERENZE in termini di STRUTTURA TERZIARIA,non so dove trovarle e se si trovano stesso in Pdb...